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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000830`

染色体: Chr03 坐标: 9523345-9526486 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000830`
名称	SmilChr03G000830
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9523345 - 9526486 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017433`
GeneID	`131017433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017433`
原始查询	`SmilChr03G000830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=35.6; qcov=0.638; evalue=6.6e-61; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=36.3; qcov=0.656; evalue=5.37e-70; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802163.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802163.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802163.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802163.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9524537`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr3:9524537`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr3:9524545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:9524555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B20,B5,B57,B59
`Chr3:9524584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B60
`Chr3:9524602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C38
`Chr3:9524628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,C1,C43,C79,C86
`Chr3:9524684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,A3,B75,B91
`Chr3:9524704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B42,B85,C27,C66
`Chr3:9524765`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,A23,A7,B42,B48,B91,C40,C42,C46
`Chr3:9524776`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A11,A23,A7,B42,B48,B91,C40,C42,C46
`Chr3:9524784`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B120,B137,B35,B41,B53,C47,C57,C60,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802163.1

567 aa

284

567

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 228-390 aa PF23559 WHD_DRP 476-547 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802163.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	228	390	9.4e-40	136.7	NB-ARC domain
`XP_057802163.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	476	547	7.6e-18	65.0	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946180.1
AGAAGAAAGCTAGCCACATATTGTTTCTGATAATAATTGAGGAGAAATAGCCATTGTTACTTATACATTGTTTTTTTTGCTGAACCTAACTAAGATTCTATCAAATTCTTGACCGAAATTCTCAGGAAAAAATATACACTTGCTTTTCCTTCAACTGAGATTGATCATGGCGGCCTATGCAGCCTTGGTTTCTGTTATGCATATCATGGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCGACAAACAACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017433
ATGGCGGCCTATGCAGCCTTGGTTTCTGTTATGCATATCATGGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCGACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTCAAGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGACGAAGCTGATCCGCTAGAGATGCATATTGTAGATGCAGCTTATGCGGTTGAAGATGTTATCGAATCATATATTGTGAACGTGATTGAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802163.1
MAAYAALVSVMHIMDTIEHHHSPPISIDKQQVESLTQILTFLQEFLQGYKSPVADGDEADPLEMHIVDAAYAVEDVIESYIVNVIELGRSSPNEEFLQGYNTLYNDETDSLETLIADLAEDAVESHIWVKVRLSISKLAKICCFFNCFGDAAHAVEEVNSREEVSCINFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMEIAAEAQLQRKVSLTHAGSLTSSSNVKESKMVGFDDVQLQLLDKLTGGNRNRQIIPITGMGGIGKTTLARHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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