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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000831`

染色体: Chr03 坐标: 9523425-9524492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000831`
名称	SmilChr03G000831
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9523425 - 9524492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018279`
GeneID	`131018279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018279`
原始查询	`SmilChr03G000831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=27.1; qcov=0.946; evalue=4.78e-09; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=22.4; qcov=0.879; evalue=6.56e-06; confidence=weak
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802986.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802986.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802986.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802986.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9523470`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A11,B107,B118,B85,C66
`Chr3:9523470`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A11,B107,B118,B85,C66
`Chr3:9523474`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A11,B107,B118,B85,C66
`Chr3:9523474`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A11,B107,B118,B85,C66
`Chr3:9523489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B8,B97,C25,C42
`Chr3:9523532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:9523537`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A1,A14,A22,B115,B124,B14,B24,B27,B49,B50,B51,B54,B58,B60,B7,B74,B77,B79,B86,B9,C14,C17,C22,C26,C3,C34,C41
`Chr3:9523585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A4,A8,B107,B121,B20,B31,B35,B40,B48,B53,B59,B65,B66,B72,B87,B93,B94,C26,C36,C38,C42,C77,D8
`Chr3:9523587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr3:9523609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:9523619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C10,C74
`Chr3:9523632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947003.1
ATGACAGTAAGGGATGCCATGGAAACTATGTCATCACGTGCTCGTTCTTTCATATGTCATGGTGAAATTGAGGTTCCAGAATTGCTAGATTTCAGATTTTTGAGGACATTGAGTACATATAAGTATTTCGGAGGGTATTTAGATGAAAATGTGGTGAACTTGAGGTACCTTTCGGGTGAATTTCGTGAGGGGTTCCAAATTTCTTCTTCAATTAGTCTGCTCTGGAATCTACACATACTAATTGTTTTTGGTTGTGGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018279
ATGACAGTAAGGGATGCCATGGAAACTATGTCATCACGTGCTCGTTCTTTCATATGTCATGGTGAAATTGAGGTTCCAGAATTGCTAGATTTCAGATTTTTGAGGACATTGAGTACATATAAGTATTTCGGAGGGTATTTAGATGAAAATGTGGTGAACTTGAGGTACCTTTCGGGTGAATTTCGTGAGGGGTTCCAAATTTCTTCTTCAATTAGTCTGCTCTGGAATCTACACATACTAATTGTTTTTGGTTGTGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802986.1
MTVRDAMETMSSRARSFICHGEIEVPELLDFRFLRTLSTYKYFGGYLDENVVNLRYLSGEFREGFQISSSISLLWNLHILIVFGCGVSTAPVEIWKMHQLKHAKFVRGVMYLPDPPSGHSDVMMENLETLKGVLDFNLNEEVVKRIPNIKKLSITYKDRVKCLSYLQCLSKLESLRCIIQYGSDDEYLQSISFPHSLKKLYLYCEDSFPHLEEILEKIGSLPLLEKLELRYGQFATRSWEIVEGQFPSLKYLSLWHCVDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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