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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000832`

染色体: Chr03 坐标: 9548359-9555596 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000832`
名称	SmilChr03G000832
描述	probable disease resistance protein At1g58390
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9548359 - 9555596 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017434`
GeneID	`131017434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017434`
原始查询	`SmilChr03G000832`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58390
产物	probable disease resistance protein At1g58390
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=32.2; qcov=0.923; evalue=5.27e-54; confidence=low
Rice	`Os10g0136100` - identity=28.1; qcov=0.914; evalue=8.25e-47; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802164.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802164.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802164.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802164.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9548791`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B105,B124,B126,C1,D5
`Chr3:9548791`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B105,B124,B126,C1,D5
`Chr3:9548797`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A21,A24,A3,A4,A9,B103,B11,B113,B115,B120,B123,B130,B22,B29,B31,B37,B40,B42,B43,B50,B52,B53,B64,B69,B73,B80,B87,B89,B9,B90,B91,B95,B98,C10,C16,C19,C3,C33,C36,C45,C47,C49,C6,C63,C64,C71,C72,D7
`Chr3:9548804`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	53	A21,A24,A3,A4,A9,B103,B11,B113,B115,B12,B120,B123,B130,B15,B17,B21,B22,B29,B31,B37,B40,B42,B43,B50,B52,B53,B64,B69,B70,B73,B87,B89,B9,B90,B91,B95,B98,C10,C16,C19,C3,C33,C36,C39,C45,C47,C49,C63,C64,C71,C72,D7,D8
`Chr3:9548808`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr3:9548808`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9548826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:9548828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C10,C74
`Chr3:9548830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B19,C60
`Chr3:9548884`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B130,B15,B42,B89,C60
`Chr3:9548884`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B130,B15,B42,B89,C60
`Chr3:9548894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802164.1

729 aa

364

729

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 137-294 aa PF23598 LRR_14 511-729 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802164.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	137	294	7.9e-29	101.1	NB-ARC domain
`XP_057802164.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	511	729	4.7e-26	92.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946181.1
CATTATTTGGCTTCTTCAACTAGACGTTCAATATAATTAATCACAATTTTTAACATTCTAGATCCCTAATTCTACTCAAACGAATTTCACTATTTACAGTAAACACCGCCGGATTCCACCGTGCCCCGCCCCAGTCGTTGCTCGCCACCGCTCCTTCACTGCTTGCAGCCGCTGCTCGTTCGGCGCCACCACCTCCTTCTGTCCTTGGTCTGTCGTCAGTATCCCTGCTAGGGCAGTTTGGTCGAAGCAGAAACATGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017434
ATGTCGGATGATCTCTTATCGCTGATACACATGCTGGACAAGTATAAACTACGAAAATTCTTTGCAAAAAAGGATATAGAAAGGGTAACTACAGAGATTAGAGAGATTTTGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGATGAGAGAAGACTAAATTTTTGGGTATCTGACCTCGTCGACGTGGTTGAGGATGCCTGCGACAGTATTTGGCACGAAGACGATATCTATGATAGCGGTTTATGTGAGTCCATCTTTAGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802164.1
MSDDLLSLIHMLDKYKLRKFFAKKDIERVTTEIREILDIVRDKKLEDERRLNFWVSDLVDVVEDACDSIWHEDDIYDSGLCESIFSWMGEIKKQMLKLGDDESNMRSSQNVEDDVDVVGLEEDVEFLIHKRIVDGREYLKTVVIKGMCGIGKTTLAREIYNHPTVVDHFDRRAWVSNSTHFTMKELLIKLIQQVAVEDPDTSSSLENMDSQSLRDMLYLHLQDKRYLIVLDDMPKHMPLKSFFKDLPNQDTGSKLLLTSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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