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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000843`

染色体: Chr03 坐标: 9617494-9620788 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000843`
名称	SmilChr03G000843
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9617494 - 9620788 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017440`
GeneID	`131017440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017440`
原始查询	`SmilChr03G000843`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.1; qcov=0.889; evalue=1.19e-54; confidence=low
Rice	`Os10g0136100` - identity=26.2; qcov=1.08; evalue=2.35e-56; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802171.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802171.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802171.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802171.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9617773`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A13,A14,A19,A3,A5,B112,B127,B128,B135,B17,B18,B37,B48,B63,B68,B71,B83,B89,B90,B92,B95,B97,B99,C15,C22,C23,C37,C56,C59,C62,C63,C68,C73,C78,C8,C85,C9
`Chr3:9617775`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A13,A14,A19,A3,A5,B112,B127,B128,B132,B135,B17,B18,B37,B63,B68,B71,B83,B89,B90,B92,B95,B97,B99,C15,C22,C23,C37,C56,C59,C62,C63,C68,C73,C78,C8,C85,C9
`Chr3:9617786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:9617791`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A23,C65
`Chr3:9617791`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A23,C65
`Chr3:9617843`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C23
`Chr3:9617843`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C23
`Chr3:9617862`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A11,A15,A3,B108,B109,B111,B120,B128,B138,B33,B41,B52,B53,B78,B80,B99,C17,C36,C44,C55,C57,C58,C75,D9
`Chr3:9617867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	131	A13,A14,A15,A18,A19,A2,A22,A23,A4,A5,A7,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B111,B112,B117,B12,B120,B121,B126,B128,B13,B131,B132,B134,B16,B17,B18,B20,B24,B27,B28,B29,B31,B37,B39,B4,B40,B41,B43,B46,B47,B5,B50,B51,B53,B6,B61,B62,B63,B67,B69,B7,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B82,B83,B85,B86,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C15,C17,C19,C2,C20,C22,C26,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C42,C44,C47,C48,C5,C50,C53,C59,C6,C60,C61,C63,C65,C67,C68,C7,C71,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D5,D7,D9
`Chr3:9617904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C56
`Chr3:9617920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B41,C47,C77
`Chr3:9617931`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	77	A19,A22,A23,A24,A4,A5,A8,B100,B104,B11,B111,B112,B115,B117,B12,B122,B124,B128,B135,B136,B140,B15,B18,B20,B28,B31,B37,B43,B44,B46,B47,B49,B50,B51,B58,B62,B64,B66,B67,B69,B71,B72,B82,B84,B86,B88,B93,B98,B99,C15,C18,C20,C22,C30,C31,C34,C39,C44,C48,C5,C50,C54,C56,C59,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C71,C76,C8,C83,C9,D1,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802171.1

836 aa

418

836

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 153-307 aa PF23598 LRR_14 517-789 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802171.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	153	307	3.4e-27	95.8	NB-ARC domain
`XP_057802171.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	517	789	3.4e-31	109.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946188.1
TATTCAATCCGAAATCATTTATTTCTATACTATTAATTTATGGATTTGTTGAAATGTGTCCGTCCACGAATTAAAGCGCCTCTACTTGCCATTTAATTTTTGTCCACCAAATAAAGCCCTATTGTGGTTTTTGTACTTTTTTACTCTCATTTTTTTCTTATATTTATTACCTTTTGTCACTAATGGACCCACCTTAAAACACTTTTATCAATTTTATATTCTATATTTACTATATTTTATCACTAGTGGACCCACCCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017440
ATGTCGGAGGCCCTCCTCTTATCGCTGATACAGAAGCTGGTTATTAGTTATCGAAAGGGCAATTCCTCCTTAAAACAAAACTCAGAATATTTCCGGAAACAATTCGAGAAGATGATGGAAGAGATGAGAGAGATTGTTGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGGGAAGAAGCCTCAATTTTTTAGTATCCGACCTTGTCGATATGACTGACGATGCCATCAAGTTTTTCGATGAAGACATGATACGTTATAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802171.1
MSEALLLSLIQKLVISYRKGNSSLKQNSEYFRKQFEKMMEEMREIVDIVRDKKLEEGRSLNFLVSDLVDMTDDAIKFFDEDMIRYNLGDYESMMSIHSWMGEIKKQMLKLGDDESNIRSSEYVEDAVDVVGLDEDVEMLLRKKILDGARYRKDVFIKGMDGIGKTTLAREIYNHPTVIERFKRRAWVSNSTNHFTIKELLIKLIQQLKDPENLHTSSLLENMDNRSLRDMLRQHLQWKRYLIVLDDLPKQMHLSSFLEAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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