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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000854`

染色体: Chr03 坐标: 9762111-9763522 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000854`
名称	SmilChr03G000854
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9762111 - 9763522 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018286`
GeneID	`131018286`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018286`
原始查询	`SmilChr03G000854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT3G46710` (AT3G46710) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823824] identity=44.3; qcov=0.28; evalue=2.29e-11; confidence=weak
Rice	`Os09g0270700` - identity=34.9; qcov=0.338; evalue=6.44e-11; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802995.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802995.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802995.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802995.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9762118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:9762119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:9762160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C45
`Chr3:9762175`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B11,B127,B129,B37,C63,D3
`Chr3:9762178`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B11,B127,B129,B37,C63,D3
`Chr3:9762182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B65
`Chr3:9762205`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C77,C9
`Chr3:9762205`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C77,C9
`Chr3:9762216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C33,D3
`Chr3:9762231`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B81
`Chr3:9762231`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B81
`Chr3:9762293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B113,B97,C25,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802995.1

314 aa

157

314

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 4-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802995.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	4	74	4.1e-16	59.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947012.1
ATGGCTGGCTTTCCAGAAGATTATGAGATTTGTGCCTCAGAACTTATTAACCTTTGGATAGTTGAAGGTTTTTTTAAACATTTAGATGAATCTAAAAGCTCGGAAGAGGAAGGGGAGGATTGTTTGGAGGATTTTGTCAAGAGAAGTCTAGTTTTGGTCGCCAACAGGAAGTTTGATGGGAAAATAAAGAGTTTCAGCCTTCATGATATTGTGCGGGAATTTTGCATAAGGCAGGGTGCGAAAGAGAAGGAAAAAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018286
ATGGCTGGCTTTCCAGAAGATTATGAGATTTGTGCCTCAGAACTTATTAACCTTTGGATAGTTGAAGGTTTTTTTAAACATTTAGATGAATCTAAAAGCTCGGAAGAGGAAGGGGAGGATTGTTTGGAGGATTTTGTCAAGAGAAGTCTAGTTTTGGTCGCCAACAGGAAGTTTGATGGGAAAATAAAGAGTTTCAGCCTTCATGATATTGTGCGGGAATTTTGCATAAGGCAGGGTGCGAAAGAGAAGGAAAAAAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802995.1
MAGFPEDYEICASELINLWIVEGFFKHLDESKSSEEEGEDCLEDFVKRSLVLVANRKFDGKIKSFSLHDIVREFCIRQGAKEKEKNILLKTYTLSLVTDFVWSRRMVKMTTNIKKLGICYSKEKFDLDSRYRLNNLKYLCRLEKLKLEMNGDFSFRELLLEFELDMRGGFSLRGLNFPLQLRKLTLSGWRLSWSDMTTIGSLPSLQVLKLRNFACYGTHWETTEGEFRELRLLLIEQSNLRYWGTEASHFPRLERLILHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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