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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000860`

染色体: Chr03 坐标: 9820739-9825687 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000860`
名称	SmilChr03G000860
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9820739 - 9825687 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018289`
GeneID	`131018289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018289`
原始查询	`SmilChr03G000860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=25.4; qcov=0.991; evalue=4.58e-60; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=28.7; qcov=0.959; evalue=5.29e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802998.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802998.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802998.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802998.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9820744`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	62	A13,A18,A21,A24,B106,B112,B128,B133,B137,B138,B14,B15,B28,B29,B3,B30,B31,B37,B40,B44,B46,B47,B5,B56,B57,B6,B61,B71,B72,B77,B8,B84,B86,B95,B96,B97,B98,C11,C12,C19,C21,C30,C33,C36,C37,C38,C47,C50,C51,C53,C56,C61,C67,C69,C80,C83,C84,C86,C87,D1,D11,D5
`Chr3:9820769`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B121,B130,B50,C29
`Chr3:9820769`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B121,B130,B50,C29
`Chr3:9820786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr3:9820797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:9820814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C66
`Chr3:9820909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B38,C13
`Chr3:9820910`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B34,B38,C13
`Chr3:9820910`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B34,B38,C13
`Chr3:9820911`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B34,B38,C13
`Chr3:9820911`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B34,B38,C13
`Chr3:9821117`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B23,B69,B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802998.1

862 aa

431

862

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 137-314 aa PF23559 WHD_DRP 391-461 aa PF23598 LRR_14 516-832 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802998.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	137	314	2.8e-39	135.2	NB-ARC domain
`XP_057802998.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	391	461	7.3e-18	65.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802998.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	516	832	5.8e-25	88.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947015.1
ATGGCTTATGAAGCTCTTGATAACCTGCAACAAACCTTGCATCAAATCCTAGAGCGCCGTGATAATCTCCTCACTCATTCTAAAGAATCAGCAAGTAAGACACATGAGATTATTGAATATCTCTTCTGTGAAGAAAATATTTCATATCGTGGACCCGTAAAGCCGGAGGTCAGACTTGCAAACAGGCTGAGGGAATTAGCAGCACGGCTGGAGTCAGTCGTCGGAGATGTGGTGGATTGCATCAAGGGTAAGGGCTCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018289
ATGGCTTATGAAGCTCTTGATAACCTGCAACAAACCTTGCATCAAATCCTAGAGCGCCGTGATAATCTCCTCACTCATTCTAAAGAATCAGCAAGTAAGACACATGAGATTATTGAATATCTCTTCTGTGAAGAAAATATTTCATATCGTGGACCCGTAAAGCCGGAGGTCAGACTTGCAAACAGGCTGAGGGAATTAGCAGCACGGCTGGAGTCAGTCGTCGGAGATGTGGTGGATTGCATCAAGGGTAAGGGCTCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802998.1
MAYEALDNLQQTLHQILERRDNLLTHSKESASKTHEIIEYLFCEENISYRGPVKPEVRLANRLRELAARLESVVGDVVDCIKGKGSVSSLESTVGDVADYIKAKKSSISSITDYADVSSSSRSAITSSKDDGVVGFEEDVEVIKDWLLEGSSKLQVLPIVGRGDIGKTTLVKIVYDDASVMKHFHICAWVTISQDHSVERIVLNLLASMKGISGLRAIYRDVESEIPTESLIRKYLEYKYIRYLIVMDDIWSKKAWDDVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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