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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000861`

染色体: Chr03 坐标: 9827458-9829853 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000861`
名称	SmilChr03G000861
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9827458 - 9829853 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018290`
GeneID	`131018290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018290`
原始查询	`SmilChr03G000861`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46730` (AT3G46730) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823826] identity=29.6; qcov=0.769; evalue=2.19e-45; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=30.6; qcov=0.828; evalue=1e-58; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802999.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802999.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802999.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802999.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9827516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C57,C60
`Chr3:9827585`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B17,B22,B23,C19,C31,C49
`Chr3:9827616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827638`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B21
`Chr3:9827638`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:9827687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:9827688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802999.1

757 aa

378

757

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 184-270 aa PF23559 WHD_DRP 349-419 aa PF23598 LRR_14 475-755 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802999.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	184	270	4.6e-22	79.1	NB-ARC domain
`XP_057802999.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	349	419	1.6e-18	67.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802999.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	475	755	7.1e-22	78.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947016.1
ATGGCTTATGAAGCTCTTGATAACCTGCAACAAACCTTAGATCTGATCCTAGAACACCGCGATTATTTCCTCACTCATTCTGCAAAACAAGAAATCATATCCATCCGCTACCAATCTATTGCGTTGCAGTTGAATCTCAAACACTATCCAAACAAAGAGAGAATCAGAGAGGCAGCGAGTAAGACACATGAGATTATTGAACATCTCTTCTCTGATAAAGAGATAAAGCCGGCAATCAGACTTGCAATCAGGCTGAGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018290
ATGGCTTATGAAGCTCTTGATAACCTGCAACAAACCTTAGATCTGATCCTAGAACACCGCGATTATTTCCTCACTCATTCTGCAAAACAAGAAATCATATCCATCCGCTACCAATCTATTGCGTTGCAGTTGAATCTCAAACACTATCCAAACAAAGAGAGAATCAGAGAGGCAGCGAGTAAGACACATGAGATTATTGAACATCTCTTCTCTGATAAAGAGATAAAGCCGGCAATCAGACTTGCAATCAGGCTGAGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802999.1
MAYEALDNLQQTLDLILEHRDYFLTHSAKQEIISIRYQSIALQLNLKHYPNKERIREAASKTHEIIEHLFSDKEIKPAIRLAIRLRELAARLESIVGDVVDCINGNGSASSLEPTVGDVVDYIKLGNDSDVSSSSRSAIAIVGVDKDVKVIKDRLLVESSRLWVLPIVGTGGIASTKGISDAKSDIPMENLIYDYLKRRRYLIVMDDMWSKKAWDDVKMLFPDAGNSSGIIVTTRLQDVAAYVDSSNSIHNMSLLDSHQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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