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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000871`

染色体: Chr03 坐标: 9888327-9890420 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000871`
名称	SmilChr03G000871
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9888327 - 9890420 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018292`
GeneID	`131018292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018292`
原始查询	`SmilChr03G000871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT3G50950` (ZAR1) HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824259] identity=28.8; qcov=0.983; evalue=1.3e-58; confidence=low
Rice	`Os02g0191000` - identity=27.8; qcov=1.04; evalue=2.82e-61; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803001.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057803001.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803001.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803001.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9888335`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	101	A11,A13,A18,A20,A21,A24,A25,A7,B10,B105,B108,B109,B110,B113,B118,B12,B125,B128,B13,B130,B137,B138,B14,B15,B21,B22,B23,B27,B3,B30,B31,B35,B37,B38,B39,B40,B44,B45,B47,B5,B50,B52,B56,B57,B6,B68,B69,B77,B8,B80,B81,B84,B85,B86,B90,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C27,C29,C30,C31,C33,C36,C38,C39,C42,C43,C44,C45,C47,C53,C55,C56,C58,C61,C62,C63,C65,C71,C72,C75,C76,C78,C80,C81,C83,C86,C87,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6
`Chr3:9888339`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A1,A14,A3,A4,A6,A7,A8,B11,B111,B27,B33,B48,B49,B51,B58,B64,B7,B94,B99,C17,C24,C25,C26,C30,C35,C42,C5,C60,C62,C7,C75,C76,D10,D9
`Chr3:9888371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B22,B23,B34,B38,B39,B76,B94,C1,C13,C31,C33,C39,C44,C63,D3,D6
`Chr3:9888392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,B94,B99
`Chr3:9888405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr3:9888419`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B131,B133,C25,C53,C73
`Chr3:9888419`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B131,B133,C25,C53,C73
`Chr3:9888423`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B131,B133,B36,B52,C25,C53,C73,C8
`Chr3:9888554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:9888563`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A10,A13,A18,A4,A6,A7,A8,B1,B100,B110,B12,B122,B124,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B15,B2,B24,B27,B30,B31,B32,B36,B4,B42,B46,B48,B50,B55,B58,B6,B62,B63,B64,B66,B70,B79,B80,B84,B91,B93,B94,B98,B99,C15,C17,C18,C25,C28,C30,C42,C44,C46,C5,C51,C54,C55,C64,C66,C7,C72,C73,C75,C76,C79,C8,C82,C85,D10,D9
`Chr3:9888612`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:9888612`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803001.1

697 aa

348

697

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 19-185 aa PF23559 WHD_DRP 268-340 aa PF23598 LRR_14 364-683 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803001.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	19	185	5.5e-44	150.5	NB-ARC domain
`XP_057803001.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	268	340	6.6e-21	74.8	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803001.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	364	683	7.9e-20	71.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947018.1
ATGTCGATTACTTCATCAAGACTACCAACTGTCGCCGGCGACGATGATTTTCTGGCAATAACGAAACAGCTTTGTGCAGAATCACGCCAGCGCCAAATCATCCCGATCGTGGGGATGGGTGGCATCGGAAAGACTACTCTTGCTAGAAATGTTTACCACGATCCTTCAATTCAGGCCCTCTTTGATATCTGTGGTTGGGTCACAGTATCTCAATCTTATAGCGATGAAGAAGTTCTTTCAACTCTCCTGCGATCCTTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018292
ATGTCGATTACTTCATCAAGACTACCAACTGTCGCCGGCGACGATGATTTTCTGGCAATAACGAAACAGCTTTGTGCAGAATCACGCCAGCGCCAAATCATCCCGATCGTGGGGATGGGTGGCATCGGAAAGACTACTCTTGCTAGAAATGTTTACCACGATCCTTCAATTCAGGCCCTCTTTGATATCTGTGGTTGGGTCACAGTATCTCAATCTTATAGCGATGAAGAAGTTCTTTCAACTCTCCTGCGATCCTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803001.1
MSITSSRLPTVAGDDDFLAITKQLCAESRQRQIIPIVGMGGIGKTTLARNVYHDPSIQALFDICGWVTVSQSYSDEEVLSTLLRSFKPEVKGVEESHGSMGTKVSQTLMKRKYLIVMDDIWDIGVCDDLSVIFPDDGNGSRIILTTRLQDVATYGANSSPPHEMQLMHEDQSWELFRQKVFMNRVCDRELKDIGMAIARSCGGLPLAIVVTAGLLSTVDRARASWEEFAEKVKTVVAARDGPLEKILSLSYTDLPRHLKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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