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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000876`

染色体: Chr03 坐标: 9944069-9948351 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000876`
名称	SmilChr03G000876
描述	probable receptor-like protein kinase At5g38990
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9944069 - 9948351 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017464`
GeneID	`131017464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017464`
原始查询	`SmilChr03G000876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable receptor-like protein kinase At5g38990
产物	probable receptor-like protein kinase At5g38990
Arabidopsis	`AT5G38990` (AT5G38990) Malectin/receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833891] identity=41.4; qcov=0.527; evalue=1.54e-55; confidence=medium
Rice	`Os11g0448200` - identity=60.6; qcov=0.641; evalue=1.08e-146; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF19160 (SPARK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802199.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802199.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802199.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802199.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802199.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9945448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B115,B21,C35,C60
`Chr3:9945591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:9945681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:9945758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:9945837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:9945912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:9945972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:9946573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:9946582`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	77	A10,A13,A2,A23,A4,A6,B1,B101,B102,B105,B109,B110,B117,B119,B122,B124,B125,B13,B131,B133,B134,B136,B140,B15,B2,B22,B23,B30,B32,B34,B35,B38,B39,B45,B58,B61,B64,B66,B76,B8,B80,B81,B84,B9,B90,B91,B92,B94,B98,C1,C13,C16,C18,C28,C31,C33,C39,C4,C42,C44,C45,C46,C51,C54,C56,C63,C64,C66,C76,C8,C82,C85,C87,D10,D11,D3,D6
`Chr3:9946586`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	67	A10,A13,A2,A23,A4,A6,B1,B101,B102,B109,B117,B119,B122,B124,B125,B13,B131,B133,B134,B136,B140,B2,B22,B23,B30,B32,B34,B38,B39,B45,B58,B61,B64,B66,B76,B8,B80,B84,B9,B90,B91,B92,B94,B98,C13,C16,C18,C28,C31,C33,C39,C4,C42,C44,C45,C46,C51,C54,C56,C63,C76,C8,C82,C85,C87,D10,D6
`Chr3:9946656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:9946664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802199.1

582 aa

291

582

SPARK

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF19160 SPARK 25-176 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 287-492 aa PF00069 Pkinase 287-543 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802199.1`	Pfam	`PF19160`	SPARK	Domain	25	176	7.2e-09	36.9	SPARK
`XP_057802199.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	287	492	1.8e-44	152.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057802199.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	287	543	1.4e-47	163.1	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946216.1
TTTTAAAATAGATACAAATGATTTTCTAAGAAAAAATATTCGAGCTTTTGTCATGTGCAATCGAATTCTTACAGAAAGATGGAAGTAGCTTCTCTCTTTCCACTGGCTCTTCTTTGTGTTGTAGCCCTTTCATTACCATCACTTGGCTATTCAGCTTGCAGCTTGGATTTCTATTCATATCCATACACACCTATAGGTGGCTGCAATGGCGTCGGAGAGAGCCCCAGCGACTGGAACATCCTCCCCCAAACCACCTGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017464
ATGGAAGTAGCTTCTCTCTTTCCACTGGCTCTTCTTTGTGTTGTAGCCCTTTCATTACCATCACTTGGCTATTCAGCTTGCAGCTTGGATTTCTATTCATATCCATACACACCTATAGGTGGCTGCAATGGCGTCGGAGAGAGCCCCAGCGACTGGAACATCCTCCCCCAAACCACCTGCTGCCAGCAAGCTCTCCTCGTCTACGCTCGTGCCTTAGCCCTTGTCGCGAGGAACAGCTCGTCGGGGGCCATCTTCGTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802199.1
MEVASLFPLALLCVVALSLPSLGYSACSLDFYSYPYTPIGGCNGVGESPSDWNILPQTTCCQQALLVYARALALVARNSSSGAIFVGLDQWSQCYNTPFQLQPNVSVQSCGFDDFYYDSGACSTLTLANIDRNVTDQCSNFGSYSYDVACKTCTRKISTALDAMVKFFNVKGNDTERATCLVSLIVSVMAGRKSDASDDFERCLPALAGPEPQDYIKISDGVAEALLAVILVMIGLAAIITLIKYVTKAKKKKTKKSPGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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