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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000882`

染色体: Chr03 坐标: 10011657-10016050 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000882`
名称	SmilChr03G000882
描述	disease resistance protein RPP8-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10011657 - 10016050 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017475`
GeneID	`131017475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017475`
原始查询	`SmilChr03G000882`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP8-like
产物	disease resistance protein RPP8-like
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=31.1; qcov=1.05; evalue=4.44e-99; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.2; qcov=1.04; evalue=8.48e-82; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF24883 (NPHP3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802208.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802208.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802208.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802208.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10011729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B73,B87,B89,C35,D4
`Chr3:10011734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B22,C39,D10
`Chr3:10011809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:10011824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:10011833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr3:10011850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B76,C15
`Chr3:10011860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,D8
`Chr3:10011878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B36,B48
`Chr3:10011881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B23,C39,C58,D10
`Chr3:10011883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:10012026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C37
`Chr3:10012033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802208.1

873 aa

436

873

Rx_N

NB-ARC

NPHP3_N

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-91 aa PF00931 NB-ARC 179-348 aa PF24883 NPHP3_N 182-316 aa PF23559 WHD_DRP 436-505 aa PF23598 LRR_14 576-852 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802208.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	91	3e-25	88.8	Rx N-terminal domain
`XP_057802208.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	179	348	4.5e-32	111.7	NB-ARC domain
`XP_057802208.1`	Pfam	`PF24883`	NPHP3_N	Domain	182	316	9.4e-06	26.6	Nephrocystin 3, N-terminal
`XP_057802208.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	436	505	7.1e-17	61.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802208.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	576	852	1.5e-22	80.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946225.1
CCTTTGTCAGCCAATAAAATCCATATATAGCAAGCTATTGCCTTCGAACCATTAAAAATCCAACACATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCAAGTTCTAACACATTGACATAGAGAGAGATGGTAGAGGCAGTAGTCTCAACAACGTTGCAACTGCTGAGCGACTTACTTGTCGACAAAGTGAATTTCCTAGGAGGCGTCGAAGAAAAGGTGGAGCTGCTCAAAGACGAGCTCAAGCGGATCCAATCCTTCCTCAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017475
ATGGTAGAGGCAGTAGTCTCAACAACGTTGCAACTGCTGAGCGACTTACTTGTCGACAAAGTGAATTTCCTAGGAGGCGTCGAAGAAAAGGTGGAGCTGCTCAAAGACGAGCTCAAGCGGATCCAATCCTTCCTCAAAGACGCCAACAGAAAGCAAGCCGACGACGACAGAGTGCGCAACTGGTTGTCGGAGATCCGAGAGGTCGCCCACGACGCCAGAGACGTGATCGAGATCTTCGTGCTCAAAGTCGAGAGCAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802208.1
MVEAVVSTTLQLLSDLLVDKVNFLGGVEEKVELLKDELKRIQSFLKDANRKQADDDRVRNWLSEIREVAHDARDVIEIFVLKVESKRRLGRFSAFPKHLHYVNKVGIEIDSIQKRLVAIHRSRESYGIKDLGEEAESVSRSQVESRRRLPPWQNDEHLVGMGGDMQKLLRESILDEERRKGLSIAVVEGMAGIGKSTLARKIYNNVGVVGGFNCRCWAVVSSGFNARETIKQLIMQLPRSAKDQEKVRDEMKKMEKSTRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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