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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000902`

染色体: Chr03 坐标: 10327208-10331622 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000902`
名称	SmilChr03G000902
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10327208 - 10331622 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017561`
GeneID	`131017561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017561`
原始查询	`SmilChr03G000902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=35.7; qcov=1; evalue=2.69e-62; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.2; qcov=0.986; evalue=6.56e-47; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802345.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802345.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802345.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802345.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802345.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10327519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B9,C22,C26
`Chr3:10327610`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B128,B138,B77,B85,C38
`Chr3:10327610`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B128,B138,B77,B85,C38
`Chr3:10327615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B68,D2
`Chr3:10327655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:10327673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B35,B46
`Chr3:10327678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B69,D10
`Chr3:10327703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B9,C22,C26
`Chr3:10327725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:10327779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:10327788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B57,B7,C34
`Chr3:10327788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B7,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802345.1

423 aa

212

423

Rx_N

NB-ARC

PF18052 Rx_N 5-90 aa PF00931 NB-ARC 179-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802345.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	90	1.3e-24	86.9	Rx N-terminal domain
`XP_057802345.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	179	355	2.3e-33	115.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946362.1
GAGAAGTCAATAATTTTTCCGAATAAATCAACATTCCATATGAACAGGCATTTTCTTGTGCCATCCTCCGGGCGAGATTTTCACAATATTAAATAGATACTAAAGAGCAATTTTCTGAAATCAAGAGATCGAACGACAACAACATGGCAGAAGCGGCGATCTCATCTCTGGTGGAACTGCTGGGCGATCAGCTCATTCAGAAGGTGAAATTCCTACGAGGCGTCGAGGGAAAGGTGGAGTCACTGAAATCCGAGCTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017561
ATGGCAGAAGCGGCGATCTCATCTCTGGTGGAACTGCTGGGCGATCAGCTCATTCAGAAGGTGAAATTCCTACGAGGCGTCGAGGGAAAGGTGGAGTCACTGAAATCCGAGCTCAAGAGGATGCAATCCTTTCTGGAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTGAAGACAAGAGGGTGTATAATTGGATATCGGAGATCAGAGAGGTTGCTCAGGATGCCGAAGATACCATCGAGATGTTCCTCATCAATGTTGAGAACTCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802345.1
MAEAAISSLVELLGDQLIQKVKFLRGVEGKVESLKSELKRMQSFLEDANKKQFEDKRVYNWISEIREVAQDAEDTIEMFLINVENSKSKGLLKRCTSFAKRMYQLDGIGDEIESIRGRLDAIDKSRERYGIKDFGQEATADSGWRLQVESRRRLSPLKNDEHLVGVEDDVKTLLEESILNEERKGLSIAVLEGMGGIGKSTLARAIYNHRDVAGRFDSRGWVAVSSEFTPQETIKQLIFRLQRYDQDKQKLLKKMKNLEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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