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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000909`

染色体: Chr03 坐标: 10414546-10416724 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000909`
名称	SmilChr03G000909
描述	uncharacterized SmilChr03G000909
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10414546 - 10416724 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018296`
GeneID	`131018296`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018296`
原始查询	`SmilChr03G000909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0523100; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os05g0523100; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G22730` (AT3G22730) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821844] identity=26.4; qcov=0.38; evalue=4.55e-06; confidence=low
Rice	`Os05g0523100` - identity=39.5; qcov=0.28; evalue=4.54e-13; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018296

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803005.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803005.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803005.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803005.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803005.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10414605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:10414616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:10414633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B78
`Chr3:10414780`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B29,B9
`Chr3:10414780`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B29,B9
`Chr3:10414795`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B74,C14
`Chr3:10414795`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:10416026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:10416046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B124
`Chr3:10416072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B120,B80,B82,C3
`Chr3:10416078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10416126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B120,B80,B82,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803005.1

389 aa

194

389

FBA_1

PF07734 FBA_1 21-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803005.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	21	118	2.9e-11	43.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947022.1
ATGTTTCCTACCGAGGAAGTCTCTCAATTTGATGAGAGGAGGACCTTGTTGCTTGGTGCTTGTATCGGCTATGATTCTAAATGTGATGATTACAAAATCCTAAGAGTTTGTCAACGTGTTATAACGGCACCCTCCTCTTATGGGACGCTCAATACTTATCAGTTGTATTCGTTCAAAGAGGATTCTTGGAACCAAATTGATCGTGTTGCTAATCCTGATGATACATCTAAGTCTAGTTTTCAAGCTGCATTTGTTAGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018296
ATGTTTCCTACCGAGGAAGTCTCTCAATTTGATGAGAGGAGGACCTTGTTGCTTGGTGCTTGTATCGGCTATGATTCTAAATGTGATGATTACAAAATCCTAAGAGTTTGTCAACGTGTTATAACGGCACCCTCCTCTTATGGGACGCTCAATACTTATCAGTTGTATTCGTTCAAAGAGGATTCTTGGAACCAAATTGATCGTGTTGCTAATCCTGATGATACATCTAAGTCTAGTTTTCAAGCTGCATTTGTTAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803005.1
MFPTEEVSQFDERRTLLLGACIGYDSKCDDYKILRVCQRVITAPSSYGTLNTYQLYSFKEDSWNQIDRVANPDDTSKSSFQAAFVRGKCYWCVALDRIESWDCSEKTLSYMDFPPERRITRYGQLVQINGGDSLGFVGFSDRDPKVGHDYELWVWSEELKRWDRQFSVSLGGAVGRPVGTIFGTFLFLHGMTGTPDEYIRRLVAYDWSKEACKELGIRNYRFRINVLCDVEGTVVLPCGKHGKPISRSSIINNPPIVTVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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