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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000911`

染色体: Chr03 坐标: 10433127-10435931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000911`
名称	SmilChr03G000911
描述	probable disease resistance protein RF45
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10433127 - 10435931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017531`
GeneID	`131017531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017531`
原始查询	`SmilChr03G000911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein RF45
产物	probable disease resistance protein RF45
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.8; qcov=0.899; evalue=2.22e-56; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=23.9; qcov=1.05; evalue=9.17e-45; confidence=weak
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802299.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802299.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802299.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802299.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10433267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B107,B122
`Chr3:10433267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B122
`Chr3:10433282`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A4,B134,B137,B16,C15,C24,C35,C42,C62,C79,D2,D9
`Chr3:10433320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B8,B98
`Chr3:10433372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:10433388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B48
`Chr3:10433450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B117
`Chr3:10433453`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,A16,B38,B64,B82,C13,C54,C65,C73,C75
`Chr3:10433454`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,A16,B38,B64,B82,C13,C54,C65,C73,C75
`Chr3:10433476`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A10,B64,B82,C13,C54,C65,C73,C75
`Chr3:10433480`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A10,B64,B82,C13,C36,C54,C73,C75
`Chr3:10433493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802299.1

799 aa

400

799

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 114-267 aa PF23598 LRR_14 478-752 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802299.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	114	267	1.4e-25	90.5	NB-ARC domain
`XP_057802299.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	478	752	2.2e-27	96.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099646.1
AGGAAAAGGAAAGAGTAATTGAAGAAATGAAAGAGATTATGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGACGGGAGAAGCCTAAATTTTTTGGTATCTGACCTTGTCGATGTGGCTGACTATGCCCTCCACCTTGTCAAACGAGACGTAACCTATGATGAGAGATATGCGTCCATCCATAGTTGGATCGGAGAGATCAAGAAGCGGATGCTTAAACTGGGAGATGATGGGGCGGAGATGGAGCCAGAGTCGAACATGAGG...

XM_057946316.1
AGGAAAAGGAAAGAGTAATTGAAGAAATGAAAGAGATTATGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGACGGGAGAAGCCTAAATTTTTTGGTATCTGACCTTGTCGATGTGGCTGACTATGCCCTCCACCTTGTCAAACGAGACGTAACCTATGATGAGAGATATGCGTCCATCCATAGTTGGATCGGAGAGATCAAGAAGCGGATGCTTAAACTGGGAGATGATGGGGCGGAGATGGAGCCAGAGTCGAACATGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017531
ATGAAAGAGATTATGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGACGGGAGAAGCCTAAATTTTTTGGTATCTGACCTTGTCGATGTGGCTGACTATGCCCTCCACCTTGTCAAACGAGACGTAACCTATGATGAGAGATATGCGTCCATCCATAGTTGGATCGGAGAGATCAAGAAGCGGATGCTTAAACTGGGAGATGATGGGGCGGAGATGGAGCCAGAGTCGAACATGAGGTCATCCGAGAATGTTGATGATGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802299.1
MKEIMDIVRDKKLEDGRSLNFLVSDLVDVADYALHLVKRDVTYDERYASIHSWIGEIKKRMLKLGDDGAEMEPESNMRSSENVDDDKYVVGLEEDVKMLLPRRIIGGEGYFNWTVLIKGMCGIGKTTLARVIYNHPNVVKHFDRRAWVCNSTHFTIKELLLKLIQQVVPENLHTSSLLENMDNQSLRDMLCQHLRGMRYFIVLDDLPKQMHLNSFLEALPRVDESRLLLTSHITHTDIFVRNENVHQMKPLDHKQSWQLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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