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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000919`

染色体: Chr03 坐标: 10494897-10518912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000919`
名称	SmilChr03G000919
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10494897 - 10518912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017598`
GeneID	`131017598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017598`
原始查询	`SmilChr03G000919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=39.5; qcov=0.403; evalue=4.36e-09; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=44.8; qcov=0.333; evalue=2.88e-07; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802388.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057802388.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802388.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802388.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10517805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:10518338`	`T`	`TA`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	11	B101,B102,B104,B123,B127,B35,C12,C16,C3,C8,D4
`Chr3:10518344`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B101,B102,B104,B108,B127,B35,C12,C8
`Chr3:10518389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10518402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10518519`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr3:10518519`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10518525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10518526`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr3:10518526`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10518531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:10518538`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802388.1

201 aa

100

201

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 160-198 aa

XP_057802389.1

201 aa

100

201

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 160-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802388.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	160	198	1.2e-08	35.4	NB-ARC domain
`XP_057802389.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	160	198	1.2e-08	35.4	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946405.1
TTTCAAAATTGTCACTTATCTCTACAAATTTTATGTGTGAAACAATAAGTCAACTCTTCAACTGGCTCGATCTGCTCCTGATTTTATTAATTATTTTATTAGAGGTTGTTGAATATGCACGTTATTTGGCTTCTTCAACTGGACATTTATCACAATTTCTAACATTCAAAATCCATAATTCTACTCAAACGAAATTCACTATTCAGAGCCCCAAATCTAATCACAGTAAACACCGCCGGATTCCGCCGCGCCGTTGCTCG...

XM_057946406.1
TTTCAAAATTGTCACTTATCTCTACAAATTTTATGTGTGAAACAATAAGTCAACTCTTCAACTGGCTCGATCTGCTCCTGATTTTATTAATTATTTTATTAGAGGTTGTTGAATATGCACGTTATTTGGCTTCTTCAACTGGACATTTATCACAATTTCTAACATTCAAAATCCATAATTCTACTCAAACGAAATTCACTATTCAGAGCCCCAAATCTAATCACAGTAAACACCGCCGGATTCCGCCGCGCCGTTGCTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017598
ATGATAGAGAAAATCTACGAACCGCCTATGATCGTATTAAGGCCATCTGCTCGAAGTCGAACCATGTCGGAGGCCCTCCTCATATCGGTGATACAGAAGCTGAACATTAGTTATATAGAGTACATGATACCAAATCATTTTATTGATTGGGTAATTAAAGAGGTGAGAGAGATTGCGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTAGAAGACGGGAGAAGACTAAATTTTTTGGTATCTGACATTGTCAGCATGGCTGAGCATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802388.1
MIEKIYEPPMIVLRPSARSRTMSEALLISVIQKLNISYIEYMIPNHFIDWVIKEVREIADIVRDKKLEDGRRLNFLVSDIVSMAEHALDIYKQDGTNYSTASLRPWIELIKQQMLKLGDDEAEMESNMRSPENVEDDMKYVVGLEEDVQMLLRKRIIGGFNMTVLITGMSGIGKTTLAREIYNHPTVIERFKGRLWVSNYC

XP_057802389.1
MIEKIYEPPMIVLRPSARSRTMSEALLISVIQKLNISYIEYMIPNHFIDWVIKEVREIADIVRDKKLEDGRRLNFLVSDIVSMAEHALDIYKQDGTNYSTASLRPWIELIKQQMLKLGDDEAEMESNMRSPENVEDDMKYVVGLEEDVQMLLRKRIIGGFNMTVLITGMSGIGKTTLAREIYNHPTVIERFKGRLWVSNYC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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