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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000938`

染色体: Chr03 坐标: 10673071-10674949 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000938`
名称	SmilChr03G000938
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10673071 - 10674949 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018307`
GeneID	`131018307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018307`
原始查询	`SmilChr03G000938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.4; qcov=0.956; evalue=1.33e-39; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=25.2; qcov=0.992; evalue=4.4e-36; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803014.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803014.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057803014.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803014.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10673115`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A14,B102,B103,B20,B23,B45,B5,B61,B63,B67,B69,B78,B87,B88,B95,C38,C39,C44,C53,C63,C68,C71,C9,D8
`Chr3:10673232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:10673261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:10673262`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B21,B38
`Chr3:10673262`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B21,B38
`Chr3:10673266`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	132	A14,A15,A16,A19,A2,A20,A24,A3,A4,A6,A7,A9,B103,B106,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B119,B121,B125,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B134,B137,B138,B139,B16,B17,B19,B2,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B33,B35,B37,B38,B40,B46,B52,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B67,B72,B74,B79,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B94,B96,B97,B98,B99,C11,C14,C15,C17,C19,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C40,C41,C42,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C63,C67,C69,C7,C70,C74,C76,C79,C8,C80,C82,C83,C9,D1,D2,D3,D7,D8
`Chr3:10673271`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	131	A14,A15,A16,A19,A2,A20,A24,A3,A4,A6,A7,A9,B103,B106,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B119,B121,B125,B127,B128,B129,B13,B132,B134,B137,B138,B139,B16,B17,B19,B2,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B35,B37,B38,B40,B46,B49,B52,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B67,B72,B74,B79,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B94,B96,B97,B98,B99,C11,C14,C15,C17,C19,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C40,C41,C42,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C63,C67,C69,C7,C70,C74,C76,C79,C8,C80,C82,C83,C9,D1,D2,D3,D7,D8
`Chr3:10673286`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr3:10673286`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B55
`Chr3:10673290`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A19,A8,B105,B12,B17,B55,B60,B88,B99,C12,C41,C52,C60,C81,C84
`Chr3:10673298`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B71,B92
`Chr3:10673298`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B71,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803014.1

596 aa

298

596

LRR_14

PF23598 LRR_14 275-539 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803014.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	275	539	3.3e-28	99.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947031.1
ATGCCCAAACAAATGCACTTGAACTCTTTCGTGAACGCTCTTCCATATGACAATGGAAGTAGATTGTTGTTCACAAGTCACATAACTCATAGGGACATAAATGTACGCGATGAAGATGTTCATCGGATGAAAGCTTTGGATCCTAAGAAGAGCTGGCAATTGTTTCTGAAAACAATAAACCATGGCAACAAATTGGCGGGTAAGCACAAATTCCCAATGAAGTTGGAGCATATGGGAAAACAAATGTTGAGAAAATGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018307
ATGCCCAAACAAATGCACTTGAACTCTTTCGTGAACGCTCTTCCATATGACAATGGAAGTAGATTGTTGTTCACAAGTCACATAACTCATAGGGACATAAATGTACGCGATGAAGATGTTCATCGGATGAAAGCTTTGGATCCTAAGAAGAGCTGGCAATTGTTTCTGAAAACAATAAACCATGGCAACAAATTGGCGGGTAAGCACAAATTCCCAATGAAGTTGGAGCATATGGGAAAACAAATGTTGAGAAAATGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803014.1
MPKQMHLNSFVNALPYDNGSRLLFTSHITHRDINVRDEDVHRMKALDPKKSWQLFLKTINHGNKLAGKHKFPMKLEHMGKQMLRKCDGLPLAIKEVGRQLAEKKVSGGSEWEQLLESVDFGSTLKLLEPFYHKLDPMLESCFLCMAFFKKNTTLRAEKLSQIWIAGGVVDSEDDCKPYLDGLINESVIDVKDKSTNYEMNAMLHMLSIQKAEEKLSFEILRNNGNNRPSESPRHHRVIICSRDKFNYSTDQDKHLVSLFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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