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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000941`

染色体: Chr03 坐标: 10695928-10697625 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000941`
名称	SmilChr03G000941
描述	CASP-like protein 1E2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10695928 - 10697625 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017613`
GeneID	`131017613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017613`
原始查询	`SmilChr03G000941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 1E2
产物	CASP-like protein 1E2
Arabidopsis	`AT4G15630` (AT4G15630) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827240] identity=42.5; qcov=0.941; evalue=1.55e-22; confidence=medium
Rice	`Os01g0363300` - identity=47; qcov=0.867; evalue=2.5e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802412.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057802412.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057802412.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802412.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057802412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10696179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C2
`Chr3:10696180`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A19,A20,A7,B1,B100,B11,B25,B33,B49,B59,B68,B73,B90,B92,C24,C25,C40,C7,C78,C80,C85,D1,D8
`Chr3:10696195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C2
`Chr3:10696222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:10696261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B6,C2
`Chr3:10696266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B6,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802412.1

135 aa

135

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 6-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802412.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	6	128	2.7e-19	70.1	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946429.1
ACGGCCAAAAATCGTATTTCGTCATTTTTCAAAACATTTCGACTATATAAATGCACTCCGAATTTCAAATTCCTTCACATACTATTTTATTTTAAAATCTCGAAATATATTTTCTTTTAAAATATTATTATTTTGCAAGAAATGGAATATCTCAAAACAAGGATAGTAACAATGGAATTACAAATGGTGGAGAGGAGGAATATGTAGCGGTGGCTAACAAGAGAAAAATGGTGGGATGGGGTTTGTTTCTGCGTGCGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017613
ATGGTGGGATGGGGTTTGTTTCTGCGTGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCAGCGCTCAGCCTAGCTGCGGCGGTGGTTCTCAGCCTTGATAACCAGACGACGATGGTGGCGCTGCGGCGGGTGATTGTTCCGGTTACGGCTAAGCGGCATTACTTTTCCGCTTTTGTGCACTTTGTGGTGGCAAATGCTATACCAAGAGTGTGGACCGTGTGGTACCATGTGGTGGTGGTGGTGGTTTCCGATTTAGTGACGACGGCGTTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802412.1
MVGWGLFLRAAAAAAAALSLAAAVVLSLDNQTTMVALRRVIVPVTAKRHYFSAFVHFVVANAIPRVWTVWYHVVVVVVSDLVTTALLFSSFGAAVAVGLIGREGNSHVQWRKVCDVFEKFWWSLQLAIFNLHNKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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