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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000969`

染色体: Chr03 坐标: 10987058-10988224 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000969`
名称	SmilChr03G000969
描述	uncharacterized SmilChr03G000969
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10987058 - 10988224 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018316`
GeneID	`131018316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018316`
原始查询	`SmilChr03G000969`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41490` (AT5G41490) F-box associated ubiquitination effector family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834150] identity=27.1; qcov=0.428; evalue=5.62e-07; confidence=low
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=25.6; qcov=0.665; evalue=6.7e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803022.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803022.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803022.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803022.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10987090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr3:10987119`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B101,B140,B20,B93,C53
`Chr3:10987119`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B101,B140,B20,B93,C53
`Chr3:10987269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:10987423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A8,B101,B125,B27,B31,B48,B66,B77,B9,B92,B94,C2,C22
`Chr3:10987457`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	41	A16,A24,A7,A8,B104,B111,B113,B114,B122,B136,B32,B38,B44,B55,B61,B63,B64,B73,B76,B8,B80,B83,B91,C1,C12,C14,C18,C2,C25,C27,C28,C30,C4,C42,C46,C52,C59,C69,D10,D5,D6
`Chr3:10987473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B94
`Chr3:10987586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,B89
`Chr3:10987609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B133,C36,C64
`Chr3:10987649`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B16,B74,B89
`Chr3:10987649`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B16,B74,B89
`Chr3:10987717`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803022.1

388 aa

194

388

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 53-294 aa PF07734 FBA_1 59-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803022.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	53	294	3.8e-17	63.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803022.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	59	305	9.8e-17	61.6	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947039.1
ATGGAACGGCTTCTTATTCTACGCTCCGTTACCCATCACCACTATCGTCGTGATAGTGAATATTTGTCGGCACTCACTCCTTCTGGGCACGTGGATTATGACCATGAAAATCTCATCCTCCCCTTCTCCTGCTTATCTCCCGTAACGGGTATCAGCGCCGGCGGATTAGTATACTTATTCGATATCCACGAGGGCAAGAGCGTGATCTGCAATCCAACGACCAAAACTCTGAAATTTCTCCATCGGCGGGAGCTGCCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018316
ATGGAACGGCTTCTTATTCTACGCTCCGTTACCCATCACCACTATCGTCGTGATAGTGAATATTTGTCGGCACTCACTCCTTCTGGGCACGTGGATTATGACCATGAAAATCTCATCCTCCCCTTCTCCTGCTTATCTCCCGTAACGGGTATCAGCGCCGGCGGATTAGTATACTTATTCGATATCCACGAGGGCAAGAGCGTGATCTGCAATCCAACGACCAAAACTCTGAAATTTCTCCATCGGCGGGAGCTGCCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803022.1
MERLLILRSVTHHHYRRDSEYLSALTPSGHVDYDHENLILPFSCLSPVTGISAGGLVYLFDIHEGKSVICNPTTKTLKFLHRRELPSPPAMISCFSSAFAYHDASDDYKVVRFFSYYEPEVPRPDFHKAELFSLKGDFWKELQPPLMNGEMLRASSCGVYVNGVCYWSTKDGLYVLSFDLSSERFSPFDLPQLGKKDMRYNLLNVGGKLGVSIQKLSFKFGIVTTLPIFMWSERMWIPLFSVVNVCDVERPLLISGNRFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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