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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000981`

染色体: Chr03 坐标: 11083687-11088021 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000981`
名称	SmilChr03G000981
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	11083687 - 11088021 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017523`
GeneID	`131017523`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017523`
原始查询	`SmilChr03G000981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28; qcov=0.919; evalue=5.9e-57; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=25.9; qcov=0.894; evalue=2.89e-50; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017523

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057802282.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802282.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802282.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802282.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:11085222`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A11,A5,B10,B109,B123,B137,B17,B43,B54,B84,B89,C16,C18,C28,C46,D6
`Chr3:11085228`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A11,A5,B10,B109,B123,B137,B17,B43,B54,B84,B89,C18,C28,C46,D6
`Chr3:11085254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:11085256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:11085261`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A19,B121,B124,B49,B79
`Chr3:11085261`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A19,B121,B124,B49,B79
`Chr3:11085274`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A23,B114,B63,B70,B83
`Chr3:11085274`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A23,B114,B63,B70,B83
`Chr3:11085289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B59,C25,D8
`Chr3:11085299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:11085331`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr3:11085331`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802282.1

832 aa

416

832

NB-ARC

LRR_14

LRR_8

PF00931 NB-ARC 142-300 aa PF23598 LRR_14 516-783 aa PF13855 LRR_8 540-594 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802282.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	142	300	1.9e-22	80.4	NB-ARC domain
`XP_057802282.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	516	783	1.8e-30	106.6	Leucine-rich repeat region
`XP_057802282.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	540	594	8.6e-08	32.6	Leucine rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946299.1
TCAGCTGGCTCGAGATAAACTGGTGATATTATTATTTTATTAGTAGTTGTTAAATATGCACATTATTTGGCTTCTTCAACTGGACATTCATTATAATTAATCACAACTTTCTAACACCTTGAATCCCTTATTCTACTCAAACGAGATTCACTATTCAGAGCCCTAAATCTAATCACAGTAAACACCGCCGGATTCTGCCGCCCCGTTGCTCGCTCGGCGCCACCACGTCGCCAGCAGCCAAGTTTATGATCCCTCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017523
ATGTCCGTGGCCCTCCTCTTATCTGTGATACAGAAGCTGGACATTAGTTATTATCGAGAGAATGAAACAAATAGGGAAATGGAAAGGGTAATTAAAGAGATGAGAGAGATTCTGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGGGAAGAAGCCTCAATTTTTTTGTATCTGACCTTATCGACATGGTTGACCATGCCATCGACCTTTCCATACGAATCCAAGACTACTATATATATAGGAGCTATGAGTCCATCCATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802282.1
MSVALLLSVIQKLDISYYRENETNREMERVIKEMREILDIVRDKKLEEGRSLNFFVSDLIDMVDHAIDLSIRIQDYYIYRSYESIHSWIGEIKKRMLKLGDDESNMTSSENVDDNYVVGLEEDVEMLLRTSIIGGEDDKRYVETVVIKGMCGIGKTTLAREIYNHPTVVARFKRRRLWVSNSTDLTIKELLIKLIQQVEDPQNLHTSSLLENMDNRSLRDMLTQHLQGTPYFIVLDDMPKQMHLKSFLKALPRENNGNRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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