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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001004`

染色体: Chr03 坐标: 11364731-11365333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001004`
名称	SmilChr03G001004
描述	disease resistance protein RPH8A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	11364731 - 11365333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018322`
GeneID	`131018322`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018322`
原始查询	`SmilChr03G001004`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPH8A-like
产物	disease resistance protein RPH8A-like
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=32; qcov=0.89; evalue=3.1e-16; confidence=low
Rice	`Os08g0539900` - identity=40; qcov=0.525; evalue=1.38e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018322

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803030.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803030.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057803030.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803030.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:11364751`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B110,B123,B19,B53,C45,C51,C56
`Chr3:11364758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B126
`Chr3:11364761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B126,C51
`Chr3:11364886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C67,C83
`Chr3:11364889`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B66,C64,C66
`Chr3:11364889`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B66,C64,C66
`Chr3:11364891`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A4,B123,B21,B28,B47,B64,B80,C34,C43,C58,C71,C73,D1
`Chr3:11364894`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B16,C3
`Chr3:11364894`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B16,C3
`Chr3:11364895`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A4,B123,B16,B21,B28,B47,B64,B80,C3,C43,C58,C71,C73,D1
`Chr3:11364901`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A4,B123,B21,B28,B47,B64,B80,C43,C58,C71,C73,D1
`Chr3:11364946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803030.1

200 aa

100

200

LRR_14

PF23598 LRR_14 41-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803030.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	41	200	8.4e-16	58.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947047.1
ATGGACAAGCTACGTTACTTCATCAACGCAGCTATTGGCCGTGGACCGACAAATAAAAACATGTGGAATAAAAATATTGAGTGTTTGAGAGGAATATGGCACAAGGATTGGATGAAGTCAACTCTAACGAGTAGTTGCCATCTTCGTGAATTAGGCATAGAGTTAGGACGGATAAAGCGTGAAGAGTTGATCAAAGCGAGAGCGTCATTGGAGAAGATGCAGAATCTTGTCATACTTCACTTAATATGGCCGGAGGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018322
ATGGACAAGCTACGTTACTTCATCAACGCAGCTATTGGCCGTGGACCGACAAATAAAAACATGTGGAATAAAAATATTGAGTGTTTGAGAGGAATATGGCACAAGGATTGGATGAAGTCAACTCTAACGAGTAGTTGCCATCTTCGTGAATTAGGCATAGAGTTAGGACGGATAAAGCGTGAAGAGTTGATCAAAGCGAGAGCGTCATTGGAGAAGATGCAGAATCTTGTCATACTTCACTTAATATGGCCGGAGGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803030.1
MDKLRYFINAAIGRGPTNKNMWNKNIECLRGIWHKDWMKSTLTSSCHLRELGIELGRIKREELIKARASLEKMQNLVILHLIWPEDNYAIDIALVVPQLANLTKLKLDGEMSKCPSASMFPPNLSHLTLTGSELVDDPMAELGKLPKLLFLMLQDAAYLGETMLVLCDGFPSLEALAFRDWNGLKSVIIEEGGMPKLKHL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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