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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001005`

染色体: Chr03 坐标: 11386766-11389946 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001005`
名称	SmilChr03G001005
描述	uncharacterized SmilChr03G001005
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	11386766 - 11389946 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017603`
GeneID	`131017603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017603`
原始查询	`SmilChr03G001005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880]; symbol=AT5G38890; hit=AT5G38890; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38890` (AT5G38890) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833880] identity=67.9; qcov=0.927; evalue=2.44e-74; confidence=high
Rice	`Os02g0815800` - identity=66.3; qcov=0.933; evalue=1.56e-73; confidence=high
GO	GO:0000176 (nuclear exosome (RNase complex)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10447 (EXOSC1); PF14382 (ECR1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802397.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057802397.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802397.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802397.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057802397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:11387069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B47,C55
`Chr3:11387076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B83,B85,C39
`Chr3:11387094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B19,C65,C82
`Chr3:11387108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B72,C32
`Chr3:11387115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C71
`Chr3:11387137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:11387141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:11388226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:11388246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,C50,D2,D9
`Chr3:11388570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:11388806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B40,C58
`Chr3:11388846`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802397.1

178 aa

178

ECR1_N

EXOSC1

PF14382 ECR1_N 9-46 aa PF10447 EXOSC1 102-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802397.1`	Pfam	`PF14382`	ECR1_N	Domain	9	46	2.1e-06	28.1	Exosome complex exonuclease RRP4 N-terminal region
`XP_057802397.1`	Pfam	`PF10447`	EXOSC1	Domain	102	143	1.4e-13	52.3	Exosome component EXOSC1/CSL4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946414.1
CTCTCTAACTCTTAAGGAAAAGAATACAATGAAGGAGAGTGAAGAAGAGAACTTCGTGACGCCGGGTGATATGCTGGGGAAAGCTCTAGAGTTGAAACCTGGCTACGGCGCTTACTTCTTGTCCCACGATAAAGCCATAAACGCCTCTGTCACTGGATTCCGCTCTCTCACTCCTGCCCCTCCCGACTCCGACGACCCGAGGGCGACGGTGGAGGTGAAGGGTCACAAGGCACACGGTCCGGTGCCGGAGCCCGGAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017603
ATGAAGGAGAGTGAAGAAGAGAACTTCGTGACGCCGGGTGATATGCTGGGGAAAGCTCTAGAGTTGAAACCTGGCTACGGCGCTTACTTCTTGTCCCACGATAAAGCCATAAACGCCTCTGTCACTGGATTCCGCTCTCTCACTCCTGCCCCTCCCGACTCCGACGACCCGAGGGCGACGGTGGAGGTGAAGGGTCACAAGGCACACGGTCCGGTGCCGGAGCCCGGAGTTGTCGTTACTGCAAGAGTTACGAAGGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802397.1
MKESEEENFVTPGDMLGKALELKPGYGAYFLSHDKAINASVTGFRSLTPAPPDSDDPRATVEVKGHKAHGPVPEPGVVVTARVTKVMAKMASADIVCVGPKSVREKFTGIIRQQDVRATEIDKVEMHSLFRPGVIVKALVLSLGDARAYYLPTAKNELGVVSAENVAGATMVPRCSAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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