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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001027`

染色体: Chr03 坐标: 12002290-12003354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001027`
名称	SmilChr03G001027
描述	cytosolic sulfotransferase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12002290 - 12003354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017585`
GeneID	`131017585`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017585`
原始查询	`SmilChr03G001027`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic sulfotransferase 5-like
产物	cytosolic sulfotransferase 5-like
Arabidopsis	`AT3G45070` (AT3G45070) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823642] identity=49.4; qcov=0.966; evalue=1.85e-113; confidence=high
Rice	`Os02g0684100` - identity=47.7; qcov=0.982; evalue=1.54e-96; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008146 (sulfotransferase activity); GO:0051923 (sulfation)
KEGG	-
Pfam	PF00685 (Sulfotransfer_1); PF13469 (Sulfotransfer_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017585

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802374.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802374.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802374.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802374.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12002329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:12002393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C8
`Chr3:12002409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A13,B120,B19,B23,B29,B41,B50,B60,C47,C6,C71
`Chr3:12002511`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	D10,D11
`Chr3:12002511`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr3:12002573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:12002575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B7,C20,C37
`Chr3:12002582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C75
`Chr3:12002608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:12002642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:12002657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:12002671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A9,B103,B105,B113,B125,B65,B66,B81,C40,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802374.1

327 aa

164

327

Sulfotransfer_1

Sulfotransfer_3

PF00685 Sulfotransfer_1 65-323 aa PF13469 Sulfotransfer_3 155-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802374.1`	Pfam	`PF00685`	Sulfotransfer_1	Domain	65	323	9.1e-73	245.5	Sulfotransferase domain
`XP_057802374.1`	Pfam	`PF13469`	Sulfotransfer_3	Domain	155	249	8.8e-08	33.4	Sulfotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946391.1
TAAACACGATATAAACCCCACCCAGAAATTCTAAGATATCCAGCAAAATGTCATCATCATCTTCAAAATCCTTCCAACCGCCACAGCTATCCCAAGACTTCAAAGAGTTCCTCTCCACTCTACCAGGAAAAAAAGTATTCGCGGATGACCCTCTCTACCGCTATCATTATCAAGGTTTCTGGTACATCGATGCCATTCTCGAAGCTGTAATTGCATGCCAGGAACATTTCCAAGCGGAGGATTCCGACGTCTTCGTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017585
ATGTCATCATCATCTTCAAAATCCTTCCAACCGCCACAGCTATCCCAAGACTTCAAAGAGTTCCTCTCCACTCTACCAGGAAAAAAAGTATTCGCGGATGACCCTCTCTACCGCTATCATTATCAAGGTTTCTGGTACATCGATGCCATTCTCGAAGCTGTAATTGCATGCCAGGAACATTTCCAAGCGGAGGATTCCGACGTCTTCGTCGCCTCCGCTCCTAAATGCGGCACGGCCTGGCTGAAGGCGATTGCCTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802374.1
MSSSSSKSFQPPQLSQDFKEFLSTLPGKKVFADDPLYRYHYQGFWYIDAILEAVIACQEHFQAEDSDVFVASAPKCGTAWLKAIAFSLLNRRRHTVTSGDHPLLTCNPHDLVPFLEIGLYGSIKALDIASFPSPRLLATHIPHSSLPDSIRSGSNCKILYVARDPKDAFVSAWHYLATVGLVSPTVAEAFENFCEGLSGYGPFWDHVLGYWKQSLENPERVLFLKYEDMKARPAVEVRRVAEFLGCPFSAEEEEAGEVDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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