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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001041`

染色体: Chr03 坐标: 12129659-12133243 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001041`
名称	SmilChr03G001041
描述	protein IQ-DOMAIN 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12129659 - 12133243 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017554`
GeneID	`131017554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017554`
原始查询	`SmilChr03G001041`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 3-like
产物	protein IQ-DOMAIN 3-like
Arabidopsis	`AT3G52290` (IQD3) IQ-domain 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824394] identity=50.1; qcov=0.996; evalue=2.08e-111; confidence=high
Rice	`Os05g0123200` - identity=47.7; qcov=1.05; evalue=5.85e-111; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057802333.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802333.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802333.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802333.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057802333.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12130543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:12130725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B9
`Chr3:12130764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C78
`Chr3:12130795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:12130806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C55
`Chr3:12130970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C39
`Chr3:12131220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr3:12131259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:12131340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C68,C87,D8
`Chr3:12131678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:12131697`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	184	A10,A11,A13,A15,A16,A19,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B115,B117,B118,B121,B123,B124,B126,B127,B128,B131,B132,B135,B136,B138,B140,B18,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:12131726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802333.1

462 aa

231

462

PF00612 IQ 116-134 aa

XP_057802334.1

461 aa

230

461

PF00612 IQ 115-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802333.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	116	134	1.7e-07	31.1	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057802334.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	115	133	1.7e-07	31.1	IQ calmodulin-binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946350.1
ACGTTTCTACACTTCCTTAATTATCAGATTAAGATTTCATTCTCTCTCTCTACTCTCTCTCATAAACACACACATCTCCGCTTACACATGACAGTACTCGAGCCACCTTGGTGAGATTCACCGCTTATTTGTAGTTAAACCAGTAGCAGAAGACGAAGACGACGAAGAAGAAGACGAATTACATGTTTGCATAATCACGAATCGCCTTTGAAATTCACAAGAGCAGATCTTTCACTGACGGTAAAAAAATGGGAAAGAAA...

XM_057946351.1
ACTTCCTTAATTATCAGATTAAGATTTCATTCTCTCTCTCTACTCTCTCTCATAAACACACACATCTCCGCTTACACATGACAGTACTCGAGCCACCTTGGTGAGATTCACCGCTTATTTGTAGTTAAACCAGTAGCAGAAGACGAAGACGACGAAGAAGAAGACGAATTACATGTTTGCATAATCACGAATCGCCTTTGAAATTCACAAGAGCAGATCTTTCACTGACGGTAAAAAAATGGGAAAGAAAATGGGATGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017554
ATGGGAAAGAAAATGGGATGGCTTCACGCAGTGAAGAAAGCAATGAGCTGCGGATCAGGGCAGAGTAGTAGAAAGAAGAATCGAAAATCGGGGGACTGGGGGAAGGAGGTGCTATATTTGGATTCGTACAATGCAGAAAACGCAGCAGTGGTCCCTGCTTCTCAATCTCCGGTGGGGGAGGCGAAGCTGATGGAAGCCGAGAATGAACAGAGCAGGCATGCTTATTCTGTTGCTCTTGCGACTGCTGCAGCTGCTGAGGC...

LOC131017554
ATGGGAAAGAAAATGGGATGGCTTCACGCAGTGAAGAAAGCAATGAGCTGCGGATCAGGGCAGAGTAGTAGAAAGAATCGAAAATCGGGGGACTGGGGGAAGGAGGTGCTATATTTGGATTCGTACAATGCAGAAAACGCAGCAGTGGTCCCTGCTTCTCAATCTCCGGTGGGGGAGGCGAAGCTGATGGAAGCCGAGAATGAACAGAGCAGGCATGCTTATTCTGTTGCTCTTGCGACTGCTGCAGCTGCTGAGGCCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802333.1
MGKKMGWLHAVKKAMSCGSGQSSRKKNRKSGDWGKEVLYLDSYNAENAAVVPASQSPVGEAKLMEAENEQSRHAYSVALATAAAAEAAVAAAHAAAEVVRLTAAARGSGKTKEEIAAIKIQAAFRGHLARRALKALRGHARLRSLIEGQSVKRQATSTLKYMQLLGRMQSEVRARRTRKSEENLSIQHQIQQKHEREQLEKLRASIGEDWDDSMQSKEQIEANLQHRQEAAIRRERALAYAYTHQQTWRASSNSANQTFM...

XP_057802334.1
MGKKMGWLHAVKKAMSCGSGQSSRKNRKSGDWGKEVLYLDSYNAENAAVVPASQSPVGEAKLMEAENEQSRHAYSVALATAAAAEAAVAAAHAAAEVVRLTAAARGSGKTKEEIAAIKIQAAFRGHLARRALKALRGHARLRSLIEGQSVKRQATSTLKYMQLLGRMQSEVRARRTRKSEENLSIQHQIQQKHEREQLEKLRASIGEDWDDSMQSKEQIEANLQHRQEAAIRRERALAYAYTHQQTWRASSNSANQTFMD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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