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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001045`

染色体: Chr03 坐标: 12167638-12168189 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001045`
名称	SmilChr03G001045
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12167638 - 12168189 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018334`
GeneID	`131018334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018334`
原始查询	`SmilChr03G001045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=28.7; qcov=1.07; evalue=4.97e-12; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803043.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803043.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803043.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803043.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12167688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:12167725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C19,C63
`Chr3:12167739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,D5
`Chr3:12167754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D8
`Chr3:12167775`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr3:12167775`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr3:12167794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:12167811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:12167838`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B111
`Chr3:12167838`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B111
`Chr3:12167890`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B11,B90,B92,D5
`Chr3:12167890`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B11,B90,B92,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803043.1

183 aa

183

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 8-182 aa PF07734 FBA_1 12-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803043.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	8	182	4.1e-14	53.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803043.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	12	181	2.6e-14	53.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947060.1
ATGGCGACATTGCCGCCATATAAAATTTTGGGATGCTGTAATGGGCTGTTCTGCGTTCTCAAGAAATCAAGAAAACGTGCAGAAATTCTTAAAGAAATTTACTTGTGGAACCCATCGACTCGGACCTCCAAGAAACTGCCAGTAATTTCTAGTCCCGGCCATGTTCGTAATTACGGATTCGGTTGGGTTGAATCGAGTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGAGTGTTAGTTATTACCTGCAGGAGGAGATCAAATGGGTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018334
ATGGCGACATTGCCGCCATATAAAATTTTGGGATGCTGTAATGGGCTGTTCTGCGTTCTCAAGAAATCAAGAAAACGTGCAGAAATTCTTAAAGAAATTTACTTGTGGAACCCATCGACTCGGACCTCCAAGAAACTGCCAGTAATTTCTAGTCCCGGCCATGTTCGTAATTACGGATTCGGTTGGGTTGAATCGAGTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGAGTGTTAGTTATTACCTGCAGGAGGAGATCAAATGGGTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803043.1
MATLPPYKILGCCNGLFCVLKKSRKRAEILKEIYLWNPSTRTSKKLPVISSPGHVRNYGFGWVESSDEYKVFVSVSYYLQEEIKWVGKVYSSRKKSWKTIEHSVDLVSCGVPGIFGGRKIYWQNYGDKEKDIIFLDLKSEVFGRIELPFDQEKYGKVGVLGGFLCVLCFNYERGYQVWVMKES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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