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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001046`

染色体: Chr03 坐标: 12187211-12190470 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001046`
名称	SmilChr03G001046
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12187211 - 12190470 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017495`
GeneID	`131017495`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017495`
原始查询	`SmilChr03G001046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017495

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057802231.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802230.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802231.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802231.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12187417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:12187539`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C20,C6
`Chr3:12187543`	`ACG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C20,C6
`Chr3:12187551`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,B43,C27
`Chr3:12187551`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A3,B43,C27
`Chr3:12187554`	`TCC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A23,B42,B58,C20,C6
`Chr3:12187559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C19,C53
`Chr3:12187562`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A23,A6,B39,D8
`Chr3:12187562`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A23,A6,B39,D8
`Chr3:12187586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C39
`Chr3:12187601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C71
`Chr3:12187617`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B106,B58,B66,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802230.1

924 aa

462

924

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 231-394 aa PF23559 WHD_DRP 479-549 aa PF23598 LRR_14 602-890 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802230.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	231	394	5.2e-41	140.8	NB-ARC domain
`XP_057802230.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	479	549	3.7e-16	59.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802230.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	602	890	4.1e-16	59.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946250.1
TAATGTTTCTGATAATAATTGAGGAGATATAGTCATTTTACGCATTGTTTTTGCTGAAGCTAAACTAAGATTCCATCAAATTCTTGTTCGAAATTCTCAGAAAAATATACACTATTTTTCCTTGGATCATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTCTTTGCAGGAA...

XM_057946248.1
TAATGTTTCTGATAATAATTGAGGAGATATAGTCATTTTACGCATTGTTTTTGCTGAAGCTAAACTAAGATTCCATCAAATTCTTGTTCGAAATTCTCAGAAAAATATACACTATTTTTCCTTGGATCATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTCTTTGCAGGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131017495
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTCTTTGCAGGAATTTCTTGAAGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGATGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATGCAGCTCATGCTGTTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGAACGTGATTAAAAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057802230.1
MAAYAALVSLMHIIDTIEHHHSPPISIHKQQVESLTQILTSLQEFLEGYKSPVADGDEADPLEMRIADAAHAVEDVIESHIVNVIKMEFFEGCDSFSDYTDVADLLEMPFAENSREEVSCDSSSDYSYEADPLEMPIAENSREKIFLQGYVVDAAHGAEEVNSREEVSCINFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMETSAEAQLQRKVSSTRAGSLTSSSTVKESMMVGFDDVQLQLLDRLTGGNRNRQIIPITGMGGIGKTTLA...

XP_057802231.1
MAAYAALVSLMHIIDTIEHHHSPPISIHKQQVESLTQILTSLQEFLEGYKSPVADGDEADPLEMRIADAAHAVEDVIESHIVNVIKMVRSSPNEEFFEGCDSFSDYTDVADLLEMPFAENSREEVSCDSSSDYSYEADPLEMPIAENSREKIFLQGYVVDAAHGAEEVNSREEVSCINFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMETSAEAQLQRKVSSTRAGSLTSSSTVKESMMVGFDDVQLQLLDRLTGGNRNRQIIPITGMGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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