当前解析结果
SmilChr03G001063| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001063 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001063 |
| 描述 | sucrose nonfermenting 4-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 12332113 - 12333945 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017620 |
|---|---|
| GeneID | 131017620 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017620 |
| 原始查询 | SmilChr03G001063 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | sucrose nonfermenting 4-like protein |
| 产物 | sucrose nonfermenting 4-like protein |
| Arabidopsis | AT1G09020 (SNF4)sucrose nonfermenting-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837423] identity=72.3; qcov=0.844; evalue=2.43e-28; confidence=medium |
| Rice | Os03g0856400 (OsCBSX8)- identity=61.5; qcov=0.844; evalue=8.01e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017620 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057802421.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057802421.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057802421.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802421.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802421.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:12332206 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B44 |
Chr3:12332214 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C18 |
Chr3:12332390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr3:12332725 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。