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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001066`

染色体: Chr03 坐标: 12378259-12381472 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001066`
名称	SmilChr03G001066
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12378259 - 12381472 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017543`
GeneID	`131017543`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017543`
原始查询	`SmilChr03G001066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT3G46730` (AT3G46730) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823826] identity=31.2; qcov=0.882; evalue=8.45e-37; confidence=low
Rice	`Os08g0261000` - identity=32.6; qcov=0.664; evalue=1.75e-40; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017543

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802315.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802315.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802315.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802315.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12379113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr3:12379113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:12379121`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A8,B111,B135,B2,B30,B41,B44,B47,B83,B97,C12,C24,C39,C47,C56,C59,C74,C86,D2
`Chr3:12379158`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A16,B10,B100,B103,B123,B137,B16,B19,B45,B74,B81,C28,C31,C40,C49,C55,C57,C64,C66
`Chr3:12379176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:12379214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B9,C45
`Chr3:12379242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A5,B114,B25,B3,B44,B54,B57,B62,B7,B88,C34,C41,C5,C53,C81,C84,C86,D6
`Chr3:12379318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:12379369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B109
`Chr3:12379369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:12379382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:12379388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802315.1

541 aa

270

541

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 99-169 aa PF23598 LRR_14 226-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802315.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	99	169	1.1e-19	71.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802315.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	226	416	7e-18	65.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946332.1
TCCGCCTGTTGCAACAGAGCTGACCGACAGCATTTCAAACCGGTTGGGGAGATTAGCGGAGAGAATTAAGTCAACTTCTGAAGATTCAGTTAAGAACTTAGGAGGACTGAGTGATTCTCCAGCTGTTGGTTCATCATCAAGATCTGCACTCAAGAGTGAAGATTTTGATGGTTTTGATCAAGCTGTAGCAACAGAGTTGACTATCAGCATTTCAAACCGGTTGGGGAGATTAGCGGAGAGAATTAAGTGGACTGCTGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017543
ATGATGCGTTTCTTGGATGACCAACAAAGTTGGCGTTTGTTCCGGAAGAAGGTCTTCGGAGATCAAGATTGTCCAGTTGAGCTACAAGATGTTGGGGAGAAATATGTAAAACGTTGCGAAGGACTGCCCCTTTCAATTGTTACTGTAGCAGGACTTTTATCCAAGATTGATAGAACTCCAAAGTCGTGGAAACAAATTGGGGCAAATGATGGACAGTTGGGAACAATATTATTATCTTTGAGTTATAACGACTTGCCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802315.1
MMRFLDDQQSWRLFRKKVFGDQDCPVELQDVGEKYVKRCEGLPLSIVTVAGLLSKIDRTPKSWKQIGANDGQLGTILLSLSYNDLPQHLRECFLYMAGFPQDYEIHVSELIKLWVAEGFLEGRDESKMLEEVAEDVLEVLVERSLVMVTSVKSDGKIKRCKLHSMVRDFCSRLAGEEKVVLPIMDYFPNPIVRRHFLPQVLQNHQRISVSWCDLDLKDSVHSSCTRSIICIPQRGYRPKGSIVNFRSLKVLHVLRRNDHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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