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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001067`

染色体: Chr03 坐标: 12384119-12390927 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001067`
名称	SmilChr03G001067
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12384119 - 12390927 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018340`
GeneID	`131018340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018340`
原始查询	`SmilChr03G001067`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46730` (AT3G46730) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823826] identity=32.3; qcov=0.554; evalue=1.09e-38; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=32.1; qcov=0.57; evalue=2.96e-50; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF15801 (zf-C6H2); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803050.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803050.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803050.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803050.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803050.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12384138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr3:12384179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:12384621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr3:12384652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr3:12386868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr3:12387691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:12389765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C39,C69,C80
`Chr3:12389765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C39,C69,C80
`Chr3:12389792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C39,C69,C80
`Chr3:12389849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:12389850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,C39,C5,C80
`Chr3:12389871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803050.1

726 aa

363

726

NB-ARC

zf-C6H2

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 45-189 aa PF15801 zf-C6H2 210-243 aa PF23559 WHD_DRP 434-506 aa PF23598 LRR_14 560-724 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803050.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	45	189	4.4e-39	134.5	NB-ARC domain
`XP_057803050.1`	Pfam	`PF15801`	zf-C6H2	Domain	210	243	8.6e-12	45.7	zf-MYND-like zinc finger, mRNA-binding
`XP_057803050.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	434	506	3.7e-16	59.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803050.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	560	724	2.1e-13	50.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947067.1
ATGATCATCAAGAATAACAGTGCAGTTGCAGTACAACTTGGTGCTTCTTCTTCCACAGCAGTAGGTTCACCATTCAGATCTGCTCCAATCATCAAGATTGGCTATATGGTTGGTTTACATGAAGATTTGCTAGCAATAAAATCTCGACTCTGTGGAGAATCGCCAAATTTAGAAGTTATCCCAATCGTTGGAATGGGAGGTATAGGAAAAACTACTCTTGCAAAGTGTGTTTACGACGACCCAATAACAGTGCAACGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018340
ATGATCATCAAGAATAACAGTGCAGTTGCAGTACAACTTGGTGCTTCTTCTTCCACAGCAGTAGGTTCACCATTCAGATCTGCTCCAATCATCAAGATTGGCTATATGGTTGGTTTACATGAAGATTTGCTAGCAATAAAATCTCGACTCTGTGGAGAATCGCCAAATTTAGAAGTTATCCCAATCGTTGGAATGGGAGGTATAGGAAAAACTACTCTTGCAAAGTGTGTTTACGACGACCCAATAACAGTGCAACGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803050.1
MIIKNNSAVAVQLGASSSTAVGSPFRSAPIIKIGYMVGLHEDLLAIKSRLCGESPNLEVIPIVGMGGIGKTTLAKCVYDDPITVQRFDIRVWVTVSQDYNADVVLSVLLASMEEFDKDRSEESKDRSKEEEELPGAKVHKILKGRRYLLVMDDIWSTHAWDDVRIILPDDGNGSRVMLTTRETDVAAYACYFGEEQERDLQVQAILEKNMCPKCVELKLRREGAAFCSQECFKASWSSHKSVHLNAKSSLIASESYSEQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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