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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001075`

染色体: Chr03 坐标: 12459846-12461298 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001075`
名称	SmilChr03G001075
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12459846 - 12461298 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018342`
GeneID	`131018342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018342`
原始查询	`SmilChr03G001075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=29; qcov=0.892; evalue=1.24e-37; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=30.7; qcov=0.956; evalue=1.25e-41; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803051.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803051.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803051.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803051.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12460204`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B109,C45
`Chr3:12460204`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B109,C45
`Chr3:12460216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B25,C41,C84
`Chr3:12460261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B127,B129,B37,C63
`Chr3:12460288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A8
`Chr3:12460365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B41,C10,C74
`Chr3:12460410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:12460413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B41,C10,C74
`Chr3:12460462`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B114,C84
`Chr3:12460462`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B114,C84
`Chr3:12460490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:12460533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803051.1

409 aa

204

409

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 157-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803051.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	157	364	7e-43	146.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947068.1
CAATTCATAGTTTGTAGAATAATTGCCAGATTATTTAAATATCATAAAAATATATTAATTGTCAAATAATTTGTTCGTTTTGTGAAGTCATGCTTGCATATTTTTTCAGAAAATGCATAAGCGAGCAGCAGTATTGCGTTTCTCTTACAAGTAGTTTCTTTCCCTTCTCTTTCTTATTATACCTTTGAGTATCCCAATCTTGTAGCTAGGAGTGTGTGTAAGAATGGCTTATTCTACACTTGCACTTGTTTCACTTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018342
ATGGCTTATTCTACACTTGCACTTGTTTCACTTGAAAAAACTATCAATCACTTCCTCCATCATAATCAATTTTCCATTTCTCCTCATGAAAAACAGCAGATTTTATCTCTTGATAAATATGTAGTTTCATTCCTATATTTTCTTGAAGATTTTGGGGGAAAAGCCACGCCTTTAGAAGCAAGAATAAGGGATGTAGCAGTGGAGGCTGAAGATGCTATTGAATGGCATATGTGGGTAAAAATCCGCTACAACTTTAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803051.1
MAYSTLALVSLEKTINHFLHHNQFSISPHEKQQILSLDKYVVSFLYFLEDFGGKATPLEARIRDVAVEAEDAIEWHMWVKIRYNFRYTLWIAKLIRGIKFIFQLRRVIDQMDSIAAEVVEIKNTIIIEGAKLDDPVGASSSSSQDANAGNSHVVGLDKDLRAIQDWLCGDSRQLQILPVTGMGGIGKTTLATNAFDHPLIMEHFDIRAWVTISQDYSQERLLSDLLDAMKEFDPGMRKKSVAENSQQGNESRGEESNGKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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