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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001077`

染色体: Chr03 坐标: 12469248-12470919 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001077`
名称	SmilChr03G001077
描述	auxin efflux carrier component 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12469248 - 12470919 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017580`
GeneID	`131017580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017580`
原始查询	`SmilChr03G001077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin efflux carrier component 5-like
产物	auxin efflux carrier component 5-like
Arabidopsis	`AT5G16530` (PIN5) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831515] identity=62.6; qcov=1; evalue=1.2e-157; confidence=high
Rice	`Os01g0919800` (OsPIN5a) - identity=55; qcov=1.03; evalue=5.64e-134; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009926 (auxin polar transport); GO:0010315 (auxin export across the plasma membrane); GO:0010329 (auxin efflux transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802367.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802367.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057802367.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802367.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802367.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12469591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,B99,C33
`Chr3:12469642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B22,B70,C15,D9
`Chr3:12469650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C6
`Chr3:12469706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C52,D10
`Chr3:12469721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B72,C71,D10
`Chr3:12469767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:12469784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B107
`Chr3:12469785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B94,C33,C63,C64,C66
`Chr3:12469801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B75,C59,D8
`Chr3:12469805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B97,C82
`Chr3:12469806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:12469816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B43,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802367.1

353 aa

176

353

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 10-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802367.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	10	345	7.9e-72	242.5	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946384.1
TATTTATTTATTACTTTCATGTTTCAATTTTCCTTTGCATCATTTTTCTTATTTTTTATTTTTATTCCATTAAATTATATATTTTTCATGTCCATCTATTTTTAGTTTTTTTGTATAAATTCATTGGGATGGTGAGAAGAGAGCAGGAGAAGATATATAAATTTTAGGGGATTGGCGTGAATTCATGAGAGACAGCCTGAGATTTATTACTTTTTCTTGTGCATGAATCAGGATTCAGAATGATGATAATTTTCTCTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017580
ATGATAGGATGGGGAGACGTGTGGAAGGTGGTCGAGGCGATGACGCCGTTGTACGTAGCGTTGATTTTGGGATACGGGTCGGTGAAATGGTGGCGAATATTGCGCGTGGAGGTGTGCGAGGCCATCAACCATCTAGTGTTTTACTTCACTTACCCATTGTTTGTGTTCGAGTTCGCCGCTCACGTGAACCCTTACACCATGAACTACCCATTGATGGCCGCCGATGTGGTTTCGAAGGTCATAATAGTGGCGGCGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802367.1
MIGWGDVWKVVEAMTPLYVALILGYGSVKWWRILRVEVCEAINHLVFYFTYPLFVFEFAAHVNPYTMNYPLMAADVVSKVIIVAALACWAKWCPHGSYSWSITSFSLTTLTNSLVVGVPFLQPMYGQVGVNLVVQSSVFQALVWTTILLFIFELRDLRRPSPAPTDTYHDLENHPTTDALAEEIIAPPLSLRKLIKKVALKIAKNPNFYACILGLTWAFLSNRWHFSMPSIMEESILILSRAGTGTTMFNMGLFMASQEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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