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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001089`

染色体: Chr03 坐标: 12583704-12586968 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001089`
名称	SmilChr03G001089
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12583704 - 12586968 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017532`
GeneID	`131017532`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017532`
原始查询	`SmilChr03G001089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=25.6; qcov=1.09; evalue=2.32e-62; confidence=low
Rice	`Os06g0146100` (Pi9(t)) - identity=26.2; qcov=1.15; evalue=5.32e-56; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017532

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802301.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802301.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802301.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802301.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12583909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B113,B63,B83
`Chr3:12583937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:12583961`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A1,A7,B112,B115,B120,B121,B129,B19,B2,B30,B37,B43,B58,B62,B72,B81,B87,B88,B91,B93,C13,C50,C70
`Chr3:12583964`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr3:12583964`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr3:12584000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C82
`Chr3:12584008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D9
`Chr3:12584009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B31
`Chr3:12584014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:12584025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B47,C45
`Chr3:12584098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B124,B73
`Chr3:12584184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802301.1

772 aa

386

772

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 102-254 aa PF23559 WHD_DRP 309-377 aa PF23598 LRR_14 456-716 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802301.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	102	254	2.8e-37	128.6	NB-ARC domain
`XP_057802301.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	309	377	1.6e-17	64.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802301.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	456	716	3.7e-14	53.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946318.1
GCAGTTGAAGAGCGACCTGGCTTTACTCAAGGGTTTCCTCAAGCAGATGGCGGAGAAGAAGCAAAAGGAAGATCCGTTGATTTTACTGGAGAGGCAGATGAGGGATGCGGTTTACATGGTGGAGGACACCATAGACACATGCTCGATCAACGCTATCACCAACAAATCCATCCACAAGAATGTCAGACTCGACAAGGAGGTGAAATCTATTAGAGAAGACAGAATCAAACCATTGCTTGATAAGTTTGCTACACTTGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017532
ATGGCGGAGAAGAAGCAAAAGGAAGATCCGTTGATTTTACTGGAGAGGCAGATGAGGGATGCGGTTTACATGGTGGAGGACACCATAGACACATGCTCGATCAACGCTATCACCAACAAATCCATCCACAAGAATGTCAGACTCGACAAGGAGGTGAAATCTATTAGAGAAGACAGAATCAAACCATTGCTTGATAAGTTTGCTACACTTGATTTCAAATCTGGAGTCGTCCAGGATTCATTGGCCGATTCAAAAGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802301.1
MAEKKQKEDPLILLERQMRDAVYMVEDTIDTCSINAITNKSIHKNVRLDKEVKSIREDRIKPLLDKFATLDFKSGVVQDSLADSKGRDTPIRQNKVVGFDKEEDTITGYLKEKTDKLDVISIVGMPGLGKTTLARKIYQSNEIGYHFPIRIWVNISQVFDSRDVFLQILKKFFPSRDTSSLNLNDLAQTVRACLKKEKFLLVLDDVWSVVAWNQIKEVLPVDNAEGKVLITTRETDVAEKSRVYKAPDNLKFLQYEVFGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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