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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001100`

染色体: Chr03 坐标: 12665480-12666313 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001100`
名称	SmilChr03G001100
描述	uncharacterized SmilChr03G001100
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12665480 - 12666313 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018351`
GeneID	`131018351`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018351`
原始查询	`SmilChr03G001100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=47.5; qcov=1; evalue=3.14e-80; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=40.5; qcov=0.704; evalue=2.59e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018351

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803063.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803063.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803063.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803063.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12665641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A2,C39
`Chr3:12665641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C39
`Chr3:12665870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B25,C41,C84
`Chr3:12665903`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A7
`Chr3:12665903`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A7
`Chr3:12665950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,D1
`Chr3:12665962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:12666025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A24,C30,C32,C33,C68,C80,C85,D5
`Chr3:12666041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:12666107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:12666117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr3:12666137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B33,B99,C2,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803063.1

277 aa

138

277

DUF4371

PF14291 DUF4371 63-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803063.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	63	276	2.3e-89	299.7	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947080.1
ATGGGGCCTTGTCAAGTAGTTGGGCATACATATCCGAAAACTCAATTTGGCAATCAACTAAGAAGTTTTCAAGATGTGTGGTATCAAAAGTTTGTGTGGCTAGAGTATAGTGTAGCAAAAGATGCTTGTTTTTGCTTTTGGTGTTACATTTTCAAGCACCCAGATAAAACGGGTCGGTATGGAGCAGATGCGTTTACCAAAACGGGCTTTACCAATTGGAAAAAAGCGTTAATCAAATTTGCAGAGCACGTTGGAGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018351
ATGGGGCCTTGTCAAGTAGTTGGGCATACATATCCGAAAACTCAATTTGGCAATCAACTAAGAAGTTTTCAAGATGTGTGGTATCAAAAGTTTGTGTGGCTAGAGTATAGTGTAGCAAAAGATGCTTGTTTTTGCTTTTGGTGTTACATTTTCAAGCACCCAGATAAAACGGGTCGGTATGGAGCAGATGCGTTTACCAAAACGGGCTTTACCAATTGGAAAAAAGCGTTAATCAAATTTGCAGAGCACGTTGGAGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803063.1
MGPCQVVGHTYPKTQFGNQLRSFQDVWYQKFVWLEYSVAKDACFCFWCYIFKHPDKTGRYGADAFTKTGFTNWKKALIKFAEHVGDADSCHNNARIQIEAFKNQRGSVANMFRSNAIEVNIAYRARLTASLDVTRFLLKQGLAFRGHDESSSSSNRGNFLELIQWYSDHNDIVSKVLGEHAPGNNQMTCPKVQKELAHACALEVTLAIINDLGDKVFTILVDEARDISMKEQMGVVLRYVNNEGCVVERFIGIVHVADTC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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