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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001117`

染色体: Chr03 坐标: 12884676-12886638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001117`
名称	SmilChr03G001117
描述	uncharacterized SmilChr03G001117
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12884676 - 12886638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017547`
GeneID	`131017547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017547`
原始查询	`SmilChr03G001117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox297; symbol=OsFbox297; hit=Os06g0161300; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox297; symbol=OsFbox297; hit=Os06g0161300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G42730` (AT2G42730) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818873] identity=23.3; qcov=0.913; evalue=7.64e-10; confidence=weak
Rice	`Os06g0161300` (OsFbox297) - identity=24.1; qcov=1.03; evalue=2.17e-17; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802325.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802325.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802325.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802325.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12884798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C58
`Chr3:12884799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B31,B6,C19
`Chr3:12885163`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B6,B7,B74,C19,C77
`Chr3:12885163`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B6,B7,B74,C19,C77
`Chr3:12885198`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B6,B7,B74,C19,C77
`Chr3:12885198`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B6,B7,B74,C19,C77
`Chr3:12885240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C77
`Chr3:12885276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B19,B21,B71,C62
`Chr3:12885304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C53,C77
`Chr3:12885334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B83,C32,C68,D6
`Chr3:12885374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B60,C52,C74
`Chr3:12885395`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B121,C53,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802325.1

484 aa

242

484

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 190-446 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802325.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	190	446	9.1e-25	88.5	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946342.1
AGCTTCTACAACTTCTCTTCAGCGTCTCCAAGTCCAACAGTTGTTCTTCTCGTAATATAAATCTTACTATAATCTTTACTGTTCCTTTTTGCAATTTTCAGAAATTGAAAAGGTGTAAGAATGCTGAAAGAGAAGCGGGAGCGATTGGCCACCTCTACAGATGTATCCAAGGTTGATCGAATTAGCGTGCTACCGAAAGAAATATTAGGGTTGATATTGTCTTTGTTGACGGCCAAGGAACCTACTGCGACTAGCATACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017547
ATGCTGAAAGAGAAGCGGGAGCGATTGGCCACCTCTACAGATGTATCCAAGGTTGATCGAATTAGCGTGCTACCGAAAGAAATATTAGGGTTGATATTGTCTTTGTTGACGGCCAAGGAACCTACTGCGACTAGCATACTTTGTAGTTCATGGAGATACTTGTGGGCCTTAACTTTTAAGACGACGATGGATTTTGATGGCACACAATCATTACATAAGATTATTAGATTTATGGAAAATTTTGGATACACGAGTCCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802325.1
MLKEKRERLATSTDVSKVDRISVLPKEILGLILSLLTAKEPTATSILCSSWRYLWALTFKTTMDFDGTQSLHKIIRFMENFGYTSPSLRKACIGPLEEERRKFVTWVDHVIVSNQRLDQRSNLEEFKVYFDLNQTHRERIDDWLTYAFSRKVERLELSLTSLTKGVFSFLGYPHLYYEFPYKRGNLPNNFEVLKKLCLHFVSVSGEVVQLFLEKCPLLEQMSVSLSQALLSLEIVATFPSFKCLEISSCHKLKSVVLRDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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