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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001118`

染色体: Chr03 坐标: 12887736-12889641 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001118`
名称	SmilChr03G001118
描述	uncharacterized SmilChr03G001118
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12887736 - 12889641 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017563`
GeneID	`131017563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017563`
原始查询	`SmilChr03G001118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07468 (Agglutinin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057802347.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802347.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802347.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802347.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12888158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C45
`Chr3:12888185`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A20,A23,A5,A7,A9,B104,B128,B134,B15,B18,B22,B26,B28,B3,B37,B44,B49,B5,B52,B54,B57,B62,B63,B7,B77,B8,B80,B84,B88,B95,B97,C1,C16,C24,C3,C34,C37,C42,C47,C5,C53,C54,C60,C78,C8,C82,C83,C86,C87,C9,D7
`Chr3:12888205`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B120,B129,B24,B92,C19,C46
`Chr3:12888237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:12888242`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr3:12888242`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr3:12888300`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C10,C74
`Chr3:12888302`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B69,C38
`Chr3:12888302`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B69,C38
`Chr3:12888324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B111,B48,C45,D5
`Chr3:12888326`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A10,B111,B48,C45,D5
`Chr3:12888326`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A10,B111,B48,C45,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802347.1

409 aa

204

409

Agglutinin

PF07468 Agglutinin 43-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802347.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	43	120	4.9e-11	43.7	Agglutinin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946364.1
AAAATGGCAACAACTCTGGCGGCAGACCCAACTCCAAGATTCATTGTGATAAAGTCAAAACAGTATAGTGATAAAGGGCATGCATACTTCAAGGCAGAGGCAGAGGGCAGTGGTGGGTCCGTACATCTCGGTGAAGCCGACGTGTTCAGCACGCTCGTGAAGATGGAGGCCGAGCGATCAACCAGCGGCAGCAAGTACATCAGCCTGCGATTTTGTTACTCCAACAGATATTGGGTGCGGAAGGCAAACAGCAACTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017563
ATGGCAACAACTCTGGCGGCAGACCCAACTCCAAGATTCATTGTGATAAAGTCAAAACAGTATAGTGATAAAGGGCATGCATACTTCAAGGCAGAGGCAGAGGGCAGTGGTGGGTCCGTACATCTCGGTGAAGCCGACGTGTTCAGCACGCTCGTGAAGATGGAGGCCGAGCGATCAACCAGCGGCAGCAAGTACATCAGCCTGCGATTTTGTTACTCCAACAGATATTGGGTGCGGAAGGCAAACAGCAACTTGATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802347.1
MATTLAADPTPRFIVIKSKQYSDKGHAYFKAEAEGSGGSVHLGEADVFSTLVKMEAERSTSGSKYISLRFCYSNRYWVRKANSNLIVSESDQPEEDTTKPTCTLFEPVKVDDFYYLIHVQSGGRVLMDANSNYAFYVESNPRSDQGYLTLVDWDSLVNLPPRVAFKGDNGKYLQDSLFFRLNFMSDDPNAQLSIYVVEQSPDGNVRIKDSQFGYWWQVDVDTSLIYTYAYDPKRSQFWPLKIDENSIALRSIHNNNFCQR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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