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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001119`

染色体: Chr03 坐标: 12891367-12901719 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001119`
名称	SmilChr03G001119
描述	uncharacterized SmilChr03G001119
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12891367 - 12901719 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017541`
GeneID	`131017541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017541`
原始查询	`SmilChr03G001119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802311.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802311.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802311.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802311.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802311.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12898122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B40,C20
`Chr3:12898122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C20
`Chr3:12898212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:12898267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:12898269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:12898312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr3:12898332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B62,C64
`Chr3:12898344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B129,C5
`Chr3:12898346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C53
`Chr3:12898453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B127,B79,C4
`Chr3:12898478`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr3:12898478`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802311.1

554 aa

277

554

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 118-231 aa PF13952 DUF4216 398-470 aa

XP_057802312.1

377 aa

188

377

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 174-272 aa

XP_057802313.1

377 aa

188

377

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 174-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802311.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	118	231	4.5e-44	149.7	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057802311.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	398	470	4.3e-20	72.7	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057802312.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	174	272	2e-09	38.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057802313.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	174	272	2e-09	38.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946329.1
AATTCCACATCATTTGTATTTTATATGTTATTTTATTTATTATATTATACATCATAATTAAACATTGTAAATGAATATGGGATCCATCGATTCACCAAAGCCGACCACCCCATTTCTGCAATTTCCTTTCTCCGCGCCGATCACAAGATATCCATTTCACCCCCACCGGCGATTCGCCCTACCAGCCGCAGCCGCGATCTGCCATCTTCCACCGCGATTCGCCGCTCCCCTTTCCCCTCCACCGCTTTCTGCCCCGTCAC...

XM_057946328.1
ACAGCCGAAAATATGCGATGGCATGCGACTTCAATAGAAGATGGGATCATGCGCCTGAATTGAACATCTTCTGTCGACGGCCTGAATTGAAGAAAGTGGATGGATCCCGACTGTATCCAAAATCATGTTATACGCTTGAAAGGGATGAAAAGAAAATCTTACTTCAATGGATCAAGAGTCTTAAGTTTCCCGATGGGTACATGCCAAATATTAGCAGATGCGTTGATTTGAACGCTCTGAAGATGCATAACATGAAAAGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131017541
ATGGCATGCGACTTCAATAGAAGATGGGATCATGCGCCTGAATTGAACATCTTCTGTCGACGGCCTGAATTGAAGAAAGTGGATGGATCCCGACTGTATCCAAAATCATGTTATACGCTTGAAAGGGATGAAAAGAAAATCTTACTTCAATGGATCAAGAGTCTTAAGTTTCCCGATGGGTACATGCCAAATATTAGCAGATGCGTTGATTTGAACGCTCTGAAGATGCATAACATGAAAAGCCACGACTGTCACGTGTT...

LOC131017541
ATGTCTCATCGTAGAGGATTGTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTGGGCCTGAGGCACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTATATTTCCGCTACTCCAGAGTCTGGTTCCCCTCCACAGAGCGCTGCTGCATCTGGGTCTAGAAGGTCCAAAGGCAAATCAGTGGCGCAGATTAGGGCCGAGTGTGTTAGGCGCGACGGGAGGATCCTCTTTCAGAGGAATACTGTTGGTAAGTTGATCGAGCCCCCGGGGATCTCCAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057802311.1
MACDFNRRWDHAPELNIFCRRPELKKVDGSRLYPKSCYTLERDEKKILLQWIKSLKFPDGYMPNISRCVDLNALKMHNMKSHDCHVFMQLLLPVAFKELLPKNVWEAITELSCFFRELTARNISIHDMGILNEKISVTLCKLERIFPPSFFDSMEHLPVHLADEARLAGPVQYRWMYPFERYLRTLKNHIRNKAKVEGSISNAYILEEMSTFSSYYFEDHVTTKWRNLPRNIEESVEDSDDPNQLLIFKPVGRPIGRMTK...

XP_057802312.1
MSHRRGLLGFGSRSSGPEAQSSSGSGPYISATPESGSPPQSAAASGSRRSKGKSVAQIRAECVRRDGRILFQRNTVGKLIEPPGISTCCTNSFKRIPNPGGYTWKLTPPTVQELYFEEFKKEFTWNPDDEADVKKMWLEKARKRYSDNMSEYKRQLKQKTEAGEIMETPLGMSDTFWMGLKAYWDQDEVKVVSRRARENRYSEPDGVGTGISRHVGGSQSSRILQQSLLVDGEVPPTASNYSTFLRLHMYADGTFVSEKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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