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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001123`

染色体: Chr03 坐标: 12930762-12931735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001123`
名称	SmilChr03G001123
描述	probable purine permease 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12930762 - 12931735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018359`
GeneID	`131018359`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018359`
原始查询	`SmilChr03G001123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable purine permease 4
产物	probable purine permease 4
Arabidopsis	`AT1G30840` (PUP4) purine permease 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839967] identity=52.6; qcov=0.74; evalue=2.95e-33; confidence=medium
Rice	`Os05g0556800` (OsPUP7) - identity=38.8; qcov=0.87; evalue=7.78e-20; confidence=low
GO	GO:0015211 (purine nucleoside transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF16913 (PUNUT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018359

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057803072.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057803072.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803072.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803072.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12931421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C28
`Chr3:12931433`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A2,B101,B73
`Chr3:12931433`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A2,B101,B73
`Chr3:12931441`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr3:12931441`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr3:12931454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B19,B50,C30
`Chr3:12931491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B113,B120,D6
`Chr3:12931505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B13
`Chr3:12931529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B36
`Chr3:12931531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A10,B100,B15,B16,B28,B6,B77,B84,B87,C46,C5,C82
`Chr3:12931543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B42,C43,C61
`Chr3:12931549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B134,B22,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803072.1

154 aa

154

PUNUT

PF16913 PUNUT 2-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803072.1`	Pfam	`PF16913`	PUNUT	Family	2	115	4.2e-28	99.2	Purine nucleobase transmembrane transport

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947089.1
ATGGAGGTGATCTACCGCGAGGTGCGGTGCTACGCGGTGGTGGTGGAGATGCAGCTGCTGATGGGGCTCTCGGCCACGACGTTCGCCACGGCGGGGATGGTGGCGGACGGCGGGTTCACGGACTTGAAATTCGAGAGCGCGGCGGGGTTCGATCGCGGTGCGGCGGCGTATTGGTGGACGATTTGGGGGGCCGCTGTGGCGTGGCAGATGTCGTTCCTGGGGACCGCGGGGATGGTGTTCCTGACGACGTCGCTGACGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018359
ATGGAGGTGATCTACCGCGAGGTGCGGTGCTACGCGGTGGTGGTGGAGATGCAGCTGCTGATGGGGCTCTCGGCCACGACGTTCGCCACGGCGGGGATGGTGGCGGACGGCGGGTTCACGGACTTGAAATTCGAGAGCGCGGCGGGGTTCGATCGCGGTGCGGCGGCGTATTGGTGGACGATTTGGGGGGCCGCTGTGGCGTGGCAGATGTCGTTCCTGGGGACCGCGGGGATGGTGTTCCTGACGACGTCGCTGACGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803072.1
MEVIYREVRCYAVVVEMQLLMGLSATTFATAGMVADGGFTDLKFESAAGFDRGAAAYWWTIWGAAVAWQMSFLGTAGMVFLTTSLTGGVCTAALLAVNVARGVVVYGDEFGGVKAPPPSSAPPKFSPQIYSHRRPQPLIKINDLTNQIATPFSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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