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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001128`

染色体: Chr03 坐标: 13035350-13046051 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001128`
名称	SmilChr03G001128
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13035350 - 13046051 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017604`
GeneID	`131017604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017604`
原始查询	`SmilChr03G001128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35.7; qcov=0.983; evalue=3.05e-22; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=35.1; qcov=0.948; evalue=3.86e-27; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802398.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802398.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802398.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802398.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13043931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B48,C45,C53,D5
`Chr3:13043955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B131,B44,C77
`Chr3:13043957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:13044001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B57,C5
`Chr3:13044037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B83,C59
`Chr3:13044068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C65
`Chr3:13044074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:13044105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D10
`Chr3:13044135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:13044177`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B136,B21
`Chr3:13044177`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B136,B21
`Chr3:13044181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802398.1

174 aa

174

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 2-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802398.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	2	171	4.4e-30	105.2	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946415.1
ATAAATTTGATAGTGAGATAGGAATGAAATAACAACATGATTAGTAAGTCAACTCTACTATTTGCTGCATGCCAAAAAAGTCAATGAAAAATATAATATTAAGCCAACTTCAACCGACTAAACTTGATCTATTTAAAAGATCGAAGAGGCTGAAAGCATTGATCGACCGATCAAGATGGCGGCGGAGGCGGCAGTGTCCACGGCGGTGCTAAAGCTGGGGGATTTGCTGACGCGGAATGCGGATTTTCTACGAGGCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017604
ATGGAGAAAGACGTAGAACTGGTGCTTGAGAAGGCAATCTTGAACGAGGGATACGACATTTCCATCTCCGCCATCGTAGGCGAGGGCGGTACCGGCAAGTCTACACTTTCAAGGGTTTTATTTAACCACGCGGCCGTGGGGGATCGATTTGAGCGGCGTGCTTGGGCTGTGGCTTCGAAGGAACGCAGGCCAAGAGACATAATCAAGGACATATATTTGCAGGTTAAGAGTGGAGAAACGATGGAGTGGGAATTGATACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802398.1
MEKDVELVLEKAILNEGYDISISAIVGEGGTGKSTLSRVLFNHAAVGDRFERRAWAVASKERRPRDIIKDIYLQVKSGETMEWELILLERLDLSEIKQRLEGKRYFIVLDDMWDDPQWNDAIAGGFPDEDTGSRFLLTLRTPDLKDNSGYVHTMKCLDSDESWILFMNTVSGGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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