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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001160`

染色体: Chr03 坐标: 13376123-13376911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001160`
名称	SmilChr03G001160
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13376123 - 13376911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018382`
GeneID	`131018382`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018382`
原始查询	`SmilChr03G001160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=30.4; qcov=0.855; evalue=6.62e-20; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018382

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803092.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803092.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803092.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803092.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13376162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B118,B26,B71
`Chr3:13376195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:13376345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B99,C87
`Chr3:13376561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:13376570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C64,C66
`Chr3:13376579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:13376583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C64,C66
`Chr3:13376584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C20,C64,C66
`Chr3:13376589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C64,C66
`Chr3:13376598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C64,C66
`Chr3:13376604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C64,C66
`Chr3:13376615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803092.1

262 aa

131

262

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 12-187 aa PF07734 FBA_1 15-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803092.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	12	187	1.6e-14	54.4	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803092.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	15	190	5.2e-15	56.0	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947109.1
ATGAGCTTTACATTGGGTTTACTGACGGAGTTCGTTCAACCGGTGGGTTGCTGTAATGGACTTGTCTGCTTTCTCAAGCAAGGGCATTTTGTCTTGTGGAATCCAGCCACTAAAATCTCCAACGAATTACCGCAAATAGTGACAGAGAATGGAGATAGACCCTCGTTCTTGATCAAATATGGGTTCGGTTGGGATGAATCGAGTGGCGCATACAAGGTGTTTGTGGATTTTTCTATCGGTCTTCACGAGCGTATGTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018382
ATGAGCTTTACATTGGGTTTACTGACGGAGTTCGTTCAACCGGTGGGTTGCTGTAATGGACTTGTCTGCTTTCTCAAGCAAGGGCATTTTGTCTTGTGGAATCCAGCCACTAAAATCTCCAACGAATTACCGCAAATAGTGACAGAGAATGGAGATAGACCCTCGTTCTTGATCAAATATGGGTTCGGTTGGGATGAATCGAGTGGCGCATACAAGGTGTTTGTGGATTTTTCTATCGGTCTTCACGAGCGTATGTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803092.1
MSFTLGLLTEFVQPVGCCNGLVCFLKQGHFVLWNPATKISNELPQIVTENGDRPSFLIKYGFGWDESSGAYKVFVDFSIGLHERMCKVYSSKTNSWKTVEYRSFGFVRGGAQVASGKLCWQRMKSNGGMNVSDVVTFDLKIEEFGEMELPCDSIVSLGVLEGCLCVFSYNKRTHFDVWIMKEDSWVKVMDVPVYEPCRIFSLVKRVLRGLNAEISLIHGSAFLVQKLNLVEEDVLSLLDVIKRSLKANIYFESLVSPVFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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