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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001163`

染色体: Chr03 坐标: 13406004-13406750 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001163`
名称	SmilChr03G001163
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13406004 - 13406750 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018384`
GeneID	`131018384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018384`
原始查询	`SmilChr03G001163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=32.2; qcov=1.09; evalue=1.74e-22; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803095.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803095.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13406442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D4
`Chr3:13406526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B14,B89,C87
`Chr3:13406631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	92	A13,A16,A18,A19,A20,A24,A4,A8,B1,B10,B101,B104,B105,B107,B108,B115,B118,B122,B124,B126,B127,B13,B130,B134,B136,B139,B14,B140,B16,B18,B22,B23,B26,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B46,B47,B52,B54,B56,B57,B61,B64,B66,B69,B71,B72,B73,B76,B8,B83,B84,B86,B87,B98,C11,C12,C13,C16,C18,C21,C24,C29,C31,C33,C36,C39,C4,C41,C45,C47,C51,C56,C58,C59,C65,C72,C78,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C86,D3,D7,D9
`Chr3:13406646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:13406669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C47
`Chr3:13406690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:13406708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C12,C79
`Chr3:13406727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B124,B18,C12
`Chr3:13406730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803095.1

248 aa

124

248

Beta-prop_KIB1-4

FBA_1

FBA_3

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 2-175 aa PF07734 FBA_1 3-181 aa PF08268 FBA_3 4-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803095.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	2	175	2.6e-07	31.2	KIB1-4 beta-propeller
`XP_057803095.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	3	181	1.3e-19	71.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803095.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	4	177	4e-20	72.8	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947112.1
ATGGTGGGGTGCTGTAATGGGCTGGTCTGTTTTCTCCAGAAACAAAGTTTTTTCTTGTGGAATCCGGCCACTGGAATCTCCAACAAATTACCGGAAATAGTGATAGAGAATGGAGATAGAACCTCGTCCGTTTACAAATATGGGTTCGGTTGGGATGAATCGAATGGTGCATACAAGGTGTTTGCCGTTTTTGCTAGCAGACTTCACGAGAGTATGTGCAAAGTTTATAGCTCGAAGACAAATTCATGGAAGACAGTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018384
ATGGTGGGGTGCTGTAATGGGCTGGTCTGTTTTCTCCAGAAACAAAGTTTTTTCTTGTGGAATCCGGCCACTGGAATCTCCAACAAATTACCGGAAATAGTGATAGAGAATGGAGATAGAACCTCGTCCGTTTACAAATATGGGTTCGGTTGGGATGAATCGAATGGTGCATACAAGGTGTTTGCCGTTTTTGCTAGCAGACTTCACGAGAGTATGTGCAAAGTTTATAGCTCGAAGACAAATTCATGGAAGACAGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803095.1
MVGCCNGLVCFLQKQSFFLWNPATGISNKLPEIVIENGDRTSSVYKYGFGWDESNGAYKVFAVFASRLHESMCKVYSSKTNSWKTVEDWEDDNVYGEGQFASGKLHWHYWEKNGGMNIVTFDLKSEEFGKMEVPCPCDSWVRLGVLEGRLCVVTYNKTHFDAWVMKEDSWVKVMDVLVYEPYQSYLLFPTVFKCLEVKIGLIRGSVISVQNLNLVKEDVLPLFNIITSSLAANIYVESLVSPVFRKKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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