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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001176`

染色体: Chr03 坐标: 13521997-13523176 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001176`
名称	SmilChr03G001176
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13521997 - 13523176 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018388`
GeneID	`131018388`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018388`
原始查询	`SmilChr03G001176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=28.2; qcov=1.15; evalue=2.81e-22; confidence=low
Rice	`Os09g0479100` (OsFbox492) - identity=27.7; qcov=0.765; evalue=1.94e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018388

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803099.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803099.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803099.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803099.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13522026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:13522027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B137,B18
`Chr3:13522047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B137,B138,B60,C73
`Chr3:13522113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A10,B48,C64,D5
`Chr3:13522113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B48,C64,D5
`Chr3:13522155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B15,C78
`Chr3:13522156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A16,B12,B21,B93,C28,C78
`Chr3:13522175`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B107,B118,B129,B14,B59,B70,B71,C2,C53,C57,C59,C7
`Chr3:13522181`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B107,B118,B129,B14,B59,B70,C2,C53,C57,C59,C7
`Chr3:13522186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B63,B83,C27
`Chr3:13522209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B43,B91,D6
`Chr3:13522230`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B107,B118,B129,B14,B20,B59,B70,C2,C53,C57,C59,C7,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803099.1

349 aa

174

349

F-box

F-box-like

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 11-49 aa PF12937 F-box-like 13-48 aa PF08268 FBA_3 67-263 aa PF07734 FBA_1 84-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803099.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	11	49	2.6e-10	40.5	F-box domain
`XP_057803099.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	13	48	9.6e-07	29.2	F-box-like
`XP_057803099.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	67	263	4.2e-14	53.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057803099.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	84	257	1.3e-20	74.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947116.1
ATGGACACCGACGGCGGCGAGCTATCTCTCCTTTTTCCTAAAGAAATCGTCGAAGAAATACTGTCAAGACTTCCGGTGGCATCGCTCTTGAAATTCCGATGCGTTTCGAAATCATGGCGTTGTTTGATTGGAAGCGACCGATTCATCAAAACCCACCTGCAAACTTCGTCCAAAAACGCATCTTTTGCCCATCACAGGCTTGTTAAGAACAAGCCTCTGAACTTGTTCGATGATATACTGTCGAGGTCCCCGGTTCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018388
ATGGACACCGACGGCGGCGAGCTATCTCTCCTTTTTCCTAAAGAAATCGTCGAAGAAATACTGTCAAGACTTCCGGTGGCATCGCTCTTGAAATTCCGATGCGTTTCGAAATCATGGCGTTGTTTGATTGGAAGCGACCGATTCATCAAAACCCACCTGCAAACTTCGTCCAAAAACGCATCTTTTGCCCATCACAGGCTTGTTAAGAACAAGCCTCTGAACTTGTTCGATGATATACTGTCGAGGTCCCCGGTTCTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803099.1
MDTDGGELSLLFPKEIVEEILSRLPVASLLKFRCVSKSWRCLIGSDRFIKTHLQTSSKNASFAHHRLVKNKPLNLFDDILSRSPVLIVGCCNGLVCCSINLQKGRFILWNPATRISKELPQFVKDNMRWSIAAYGFGWDESSNAHKVFVVLFSPKGMVGKLYSSNTNSWKIVSEYPDFDLELICGKAEFVSGKLHWLRKSGGWYAANIATFDLKSEEFGVMELPCESTRSLSVNEGCLSVVCSNYKRGHSDVWVRKQDSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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