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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001214`

染色体: Chr03 坐标: 13949030-13959688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001214`
名称	SmilChr03G001214
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13949030 - 13959688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017492`
GeneID	`131017492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017492`
原始查询	`SmilChr03G001214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=32.3; qcov=1.01; evalue=1.44e-127; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.3; qcov=0.576; evalue=2.94e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802225.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802225.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802225.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802225.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13949621`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,B37,C21,C24,C48,C79,C83
`Chr3:13949629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C39
`Chr3:13949654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:13949704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr3:13949729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B93,C21,C58
`Chr3:13949744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B93,C21
`Chr3:13949845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C28
`Chr3:13949880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A3,C50,C82
`Chr3:13949884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A3,C50,C82
`Chr3:13949891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B27,B97,C76
`Chr3:13949998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:13950014`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A25,A5,B125,B129,B49,B59,B79,B94,C56,C7,C72,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802225.1

950 aa

475

950

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-90 aa PF00931 NB-ARC 192-360 aa PF23559 WHD_DRP 447-524 aa PF23598 LRR_14 586-901 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802225.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	90	3.5e-20	72.6	Rx N-terminal domain
`XP_057802225.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	192	360	1.6e-38	132.7	NB-ARC domain
`XP_057802225.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	447	524	4e-11	43.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802225.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	586	901	6.8e-22	78.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946242.1
GTCATAGTTGAGTGGGAACAATATTCAAGATGAGCTTGTAAATAAGAGATTGATTAATGGTCTTGTGTGTGATACACCGATCAAATTATAGCAAACTATCAAAGAGAAGCATCGAATATTTGTTGCAATGGCAGAAGAAGTGGTGTCGATTGCTCTAGGAACCTTACGTGATTTGCTGTTGGAAGAAGCAAGGTTTTTATCTGGTGTTGGCGATCAAGTGAGGGAGCTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017492
ATGGCAGAAGAAGTGGTGTCGATTGCTCTAGGAACCTTACGTGATTTGCTGTTGGAAGAAGCAAGGTTTTTATCTGGTGTTGGCGATCAAGTGAGGGAGCTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTCTCCTTGAAGATGCTGACAAAAGACGGCATGAAAGCAAAACCATTTCTAATTGGATCTCGGAGATCAGAGATCTCGCATACAGAGCCGAATCCGCCATTGAATTACACGCAGCTCGAGTGTCTTCGAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802225.1
MAEEVVSIALGTLRDLLLEEARFLSGVGDQVRELEIQLKEMKCLLEDADKRRHESKTISNWISEIRDLAYRAESAIELHAARVSSRRSRRGLRQLIRRYSCIFEECYSIHQLGSEIAKIKSDLGRVTQDMRAYGINNIIDLGEGHSQAQGTTLPSSGSISGAGESSAADNNKTWSRKTFPDFEIDECFVGMEEELKQLESLLVEDKEHRVISVWGMGGSGKTTIARKVYNHIKETKNGGFESFAWVCISQQCQIRLVLED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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