当前解析结果
SmilChr03G001216| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001216 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001216 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001216 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 13973700 - 13976967 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017735 |
|---|---|
| GeneID | 131017735 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017735 |
| 原始查询 | SmilChr03G001216 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0008017 (microtubule binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017735 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057802434.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802438.1 |
| 3 | Spindle | Spindle | 0.40000 | XP_057802434.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802434.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802434.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:13973895 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr3:13974034 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr3:13974114 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B94,C14,C74 |
Chr3:13974132 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B122,B30 |
Chr3:13974164 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,B40 |
Chr3:13974167 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B128 |
Chr3:13974178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B12,C75 |
Chr3:13974185 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,C12,C54,C57,C75 |
Chr3:13974413 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr3:13974454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B16 |
Chr3:13974502 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,C60,C82,D10 |
Chr3:13974674 |
CAG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。