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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001264`

染色体: Chr03 坐标: 14627445-14631895 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001264`
名称	SmilChr03G001264
描述	auxin response factor 9-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14627445 - 14631895 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017773`
GeneID	`131017773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017773`
原始查询	`SmilChr03G001264`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 9-like
产物	auxin response factor 9-like
Arabidopsis	`AT4G23980` (ARF9) auxin response factor 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828498] identity=58.2; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0557200` (OsARF7) - identity=54.6; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA); PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802479.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802479.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802479.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802479.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14628204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:14628473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B102,B41,C10,C74
`Chr3:14628514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:14628535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B19
`Chr3:14628563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:14628752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:14628768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:14628916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:14629846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:14630420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:14631355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:14631376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B33,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802479.1

687 aa

344

687

ARF_AD

AUX_IAA

PF02362 B3 131-232 aa PF06507 ARF_AD 278-359 aa PF02309 AUX_IAA 568-612 aa PF02309 AUX_IAA 619-660 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802479.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	131	232	2.9e-25	88.8	B3 DNA binding domain
`XP_057802479.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	278	359	2.4e-36	124.2	Auxin response factor ancillary domain
`XP_057802479.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	568	612	1.7e-14	54.9	AUX/IAA family
`XP_057802479.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	619	660	1.7e-14	54.9	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946496.1
CTGCGTGTGCAGTGAAAAAGGAGACACCATTAATTTTACAACACACACTCCTCTAGAGAGAGAAAGCAACAAATCAAGGCGTATATTAAGCTGTTTTCTTCGGAATCCGTGACCCCCCCTCTTCTCCTCTCCCTCTCCTTCTCCACCAAAGTAGAAACTAGTTCAGCTTTTCTCAATTACTCGAGGAAACTTGCTCCTCTGCGGATATTTTGCTGTCAAACAATACTATTTCGCTGTAATTGAGCTGCTGGTGCATTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017773
ATGGTGAATTGGGGCTCAGTTTCTCAGCGGCAGCAGCATGTTTCTCCAGCTGAAGGGGTCTGTGTCAAGGATGCGTTGTATGAGGAGCTATGGAGGGGTTGTGCAGGGCCTTTGGTGGATGTTCCTAAGGCTGGGGAAAGAGTTTACTATTTCCCACAAGGTCACATGGAGCAGTTGGAGGCATCTACAAATCAGGAATTGAATCAGAGGATACCGATGTTCAACTTGCCTCCGAAGATCCTTTGCAAAGTTTTTAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802479.1
MVNWGSVSQRQQHVSPAEGVCVKDALYEELWRGCAGPLVDVPKAGERVYYFPQGHMEQLEASTNQELNQRIPMFNLPPKILCKVFNIQLLAEKDTDEVYAQITLMPESDQSEPRSQDSATEEPPRPAVHSFCKVLTASDTSTHGGFSVLRKHANECLPPLDMSQQTPTQELIAKDLHGNEWQFKHIFRGQPRRHLLTTGWSTFVTSKRIVAGDSFVFLRGENGELRVGVRRHARQQISIPSSVISSQSMHLGVLATASHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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