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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001271`

染色体: Chr03 坐标: 14781254-14781811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001271`
名称	SmilChr03G001271
描述	uncharacterized SmilChr03G001271
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14781254 - 14781811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018428`
GeneID	`131018428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018428`
原始查询	`SmilChr03G001271`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.9; qcov=0.815; evalue=5.84e-09; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=35.7; qcov=0.892; evalue=8.17e-21; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803133.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803133.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803133.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803133.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14781261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr3:14781302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C26
`Chr3:14781320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C16,C80
`Chr3:14781338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr3:14781343`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr3:14781343`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr3:14781346`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B96
`Chr3:14781346`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B96
`Chr3:14781349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B77,B99,C22,C26,C47
`Chr3:14781349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B99,C22,C26,C47
`Chr3:14781379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A16,B100,B102,B41,B64,B76,B79,B84,C10,C43,C74,C80,C84
`Chr3:14781407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803133.1

157 aa

157

SWIM

PF04434 SWIM 13-43 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803133.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	13	43	9.9e-08	32.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947150.1
ATGCATATGTATAGTGTTGAAAAGGACCATGCCTTCTACATTGTCGATCTCGAGAATCGAACTTGTGATTGTGCTCAGTTCGAGCTGGACGATATTCCATGTCGTCATGCTTGTGCCGCTATTAGGCGTGCAGGTTTGCAAGTGACTGACTTTGTTGGGAAATATTTCAAACAATCCATTTTGTTGGCCACATACATGCCTCGTATTGCGCCCGTGCCACATCCTATATACTGGAATGTGCCAGAGTCGATATCAACATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018428
ATGCATATGTATAGTGTTGAAAAGGACCATGCCTTCTACATTGTCGATCTCGAGAATCGAACTTGTGATTGTGCTCAGTTCGAGCTGGACGATATTCCATGTCGTCATGCTTGTGCCGCTATTAGGCGTGCAGGTTTGCAAGTGACTGACTTTGTTGGGAAATATTTCAAACAATCCATTTTGTTGGCCACATACATGCCTCGTATTGCGCCCGTGCCACATCCTATATACTGGAATGTGCCAGAGTCGATATCAACATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803133.1
MHMYSVEKDHAFYIVDLENRTCDCAQFELDDIPCRHACAAIRRAGLQVTDFVGKYFKQSILLATYMPRIAPVPHPIYWNVPESISTYIVKSSDITRHAGRPKMSRARSAVEGSSNSRSQVCSRCKGRGHNALRCKAPLALDLNVALDENESVEPPPD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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