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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001279`

染色体: Chr03 坐标: 14973411-14975653 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001279`
名称	SmilChr03G001279
描述	RNA polymerase II transcriptional coactivator KELP
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14973411 - 14975653 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017783`
GeneID	`131017783`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017783`
原始查询	`SmilChr03G001279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase II transcriptional coactivator KELP
产物	RNA polymerase II transcriptional coactivator KELP
Arabidopsis	`AT4G10920` (KELP) transcriptional coactivator p15 (PC4) family protein (KELP) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826690] identity=62.7; qcov=0.939; evalue=2.52e-64; confidence=high
Rice	`Os01g0706000` - identity=55.2; qcov=1.12; evalue=1.28e-54; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0060261 (positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF02229 (PC4); PF08766 (DEK_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017783

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802489.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057802489.1`
3	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057802489.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.60000	`XP_057802489.1`
5	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057802489.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14973762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B108,B83,B99,C23
`Chr3:14975214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B33,B87
`Chr3:14975222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:14975280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802489.1

163 aa

163

DEK_C

PC4

PF08766 DEK_C 5-59 aa PF02229 PC4 98-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802489.1`	Pfam	`PF08766`	DEK_C	Domain	5	59	7.4e-14	52.1	DEK C terminal domain
`XP_057802489.1`	Pfam	`PF02229`	PC4	Domain	98	149	3.3e-23	81.7	Transcriptional Coactivator p15 (PC4)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946506.1
ATTTTTATCAAAATTAATGTCGCTCTATTCTAGTACGTTCTTCGTGTTTCTGGTCACACCGTGTAATTTCCCTCGACAGTCTCTTTGATTTCCCAATTTATGATGAACAGCTACTGCTTGTAGCCTCTCTGCTTCTGCTTCTGCGCCCAATTTCCATAAATTCTTTTCAAAAAGTCTGACAGATTACTCGAAATAGCCCAACATTAACCTAGAAACCTAAGAAAGAGAAAGAGGGAAGACTGATGGACGCAGAAACGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017783
ATGGACGCAGAAACGCGTAATAAAATCGAGGAGACGGTTTTGGAAATCCTTAAGAATTCAAACATGGACGAAACCACCGAATTCAAGATCCGCAAATCCGCCTCCGAGAAGCTGGGAATGGACCTCTCCGACCCCGCCCGGAAGAAGCTCGTCAGGGAGGTTGTGGAGTCGTACCTCACCGAACAACAGGCCAAAGCGGAGGAGGAAGAAGAAGCCGAAGCGGAAGAGGAGGAAGACGGCGGTAGAAACAAAGGCGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802489.1
MDAETRNKIEETVLEILKNSNMDETTEFKIRKSASEKLGMDLSDPARKKLVREVVESYLTEQQAKAEEEEEAEAEEEEDGGRNKGEKEYDDEGGLIVCRLSDKRRVTLSEFRGRTLVSIREYYKRDGKELPSAKGISLTAEQWASFKKNVPGIEKAIKKMESR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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