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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001285`

染色体: Chr03 坐标: 15023982-15027894 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001285`
名称	SmilChr03G001285
描述	uncharacterized SmilChr03G001285
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15023982 - 15027894 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017790`
GeneID	`131017790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017790`
原始查询	`SmilChr03G001285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRF zinc finger / Zinc knuckle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841933]; symbol=AT1G54930; hit=AT1G54930; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	GRF zinc finger / Zinc knuckle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841933]; symbol=AT1G54930; hit=AT1G54930; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G54930` (AT1G54930) GRF zinc finger / Zinc knuckle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841933] identity=43.6; qcov=0.152; evalue=3.11e-16; confidence=weak
Rice	`Os03g0786500` - identity=35.8; qcov=0.194; evalue=1.91e-11; confidence=weak
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802499.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802499.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802499.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802499.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15024101`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	50	A22,B103,B11,B110,B111,B113,B123,B13,B140,B2,B24,B25,B3,B30,B34,B36,B38,B39,B40,B46,B47,B5,B57,B58,B82,B87,B90,B92,B93,C14,C17,C27,C3,C30,C31,C34,C35,C41,C5,C51,C53,C56,C59,C63,C67,C7,C75,C76,C80,C83
`Chr3:15024143`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A11,A18,A2,A22,A3,B102,B11,B110,B113,B119,B123,B124,B13,B135,B140,B2,B25,B3,B38,B39,B44,B46,B47,B49,B5,B53,B57,B58,B61,B65,B78,B79,B8,B82,B87,B90,B92,B98,C12,C14,C18,C27,C3,C31,C34,C41,C42,C50,C51,C56,C58,C59,C6,C60,C67,C76,C80,C83,C85,C86,D10,D2,D6
`Chr3:15024267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B70
`Chr3:15024441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B12,B68,B85,D2
`Chr3:15025692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C21,C4
`Chr3:15025775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B19,D7
`Chr3:15025838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,B73,C25,C80,C84
`Chr3:15026268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:15026322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:15026358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B12,B68,B85,D2
`Chr3:15026430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B126,B134,B66,B68
`Chr3:15026779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B130,D11

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946516.1
TGGTACAAAAACAAGTTTCAAAAAGTGGGCAACGTTAACTTTGCAGTCGCAACTGTTGACTGATTTTCACTACAGTAAGCAAAATGTGAATCAAAAGCACTCCATGATTGCAAACCTCCTTTCTCTCTCTCTACAACTTTTTTATCACTGCTTCAGAGATACAGAGAGAGAGATAATGGAAGGGCCGTCGTGGTCGGGGCACTTCCCCGCCGCCGCCCGCTACCAGCGGTGCTTCATCTGCCCCACGTGCAACGCCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017790
ATGATTGCAAACCTCCTTTCTCTCTCTCTACAACTTTTTTATCACTGCTTCAGAGATACAGAGAGAGAGATAATGGAAGGGCCGTCGTGGTCGGGGCACTTCCCCGCCGCCGCCCGCTACCAGCGGTGCTTCATCTGCCCCACGTGCAACGCCAGAAGCTGCCGCCGCCTTCAGTCCCACACCCTCAAAAACCCCGGTCGCTTCTTCTTCTCTTGCCCCGATGACAATTTTTTCAAGTGGGAAGACGAGGTGAGGCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802499.1
MIANLLSLSLQLFYHCFRDTEREIMEGPSWSGHFPAAARYQRCFICPTCNARSCRRLQSHTLKNPGRFFFSCPDDNFFKWEDEVRPHEWIEVPNCGGCGAGVCRVRKETAGPNAGRIMFMCRVKEGEGSCGYRVWQDELEMIEACQAEERALSRSGIVNCNGEVTDAVEVSKQRDEGTDHVSPSVETCDDLMCREVTSSRRMDREVVSGKMDRLKYPEEKSNLTSRRPHKRSRYGDIIASGFPISASFSTVRVALNSTST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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