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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001291`

染色体: Chr03 坐标: 15123689-15124657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001291`
名称	SmilChr03G001291
描述	LOB domain-containing protein 33-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15123689 - 15124657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017798`
GeneID	`131017798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017798`
原始查询	`SmilChr03G001291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 33-like
产物	LOB domain-containing protein 33-like
Arabidopsis	`AT5G06080` (LBD33) LOB domain-containing protein 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830495] identity=58.9; qcov=0.721; evalue=1.25e-50; confidence=medium
Rice	`Os03g0246900` - identity=63.5; qcov=0.581; evalue=1.4e-44; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009755 (hormone-mediated signaling pathway); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802507.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802507.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802507.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802507.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15123865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B64,C24,C42
`Chr3:15123867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C78
`Chr3:15123896`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:15123896`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:15123902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A2,B110,B13,B33,B37,B38,B39,B55,B70,B78,B82,C12,C20,C23,C31,C75,C78,D1
`Chr3:15123996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:15124288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B49,B79
`Chr3:15124291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:15124317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B132,B21,C22,C53
`Chr3:15124340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D7
`Chr3:15124344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr3:15124479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B19,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802507.1

179 aa

179

LOB

PF03195 LOB 7-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802507.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	7	104	3.2e-32	111.7	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946524.1
AAGTTAGTTATGCTCACACCACACACACACACACACTACACAAGACATGACAAAAATCTAGGATTATAATCCATGTAAAAGAAAAATAGAAAATATTAGGACAATGACTGGAGCTGGTTCTTCATGCGGAGCGTGTAAGTTCTTGAGAAGAAGGTGCATCCTCGACTGCACGTTTGCGCCTCATTTCAGCTACGAGCAAGCTGCAGCCCACTTTGCAGCCGTTCACAGGGTCTTTGGCGCGAGAAACGTCTCAAAGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017798
ATGACTGGAGCTGGTTCTTCATGCGGAGCGTGTAAGTTCTTGAGAAGAAGGTGCATCCTCGACTGCACGTTTGCGCCTCATTTCAGCTACGAGCAAGCTGCAGCCCACTTTGCAGCCGTTCACAGGGTCTTTGGCGCGAGAAACGTCTCAAAGATGCTGCTGCGCCTGCCCCTGCACAGCAGAGGCGACGCTGCTGCCATGATCTGCTACGAGGCCCTTGCACGTGTGCAGGACCCCGTCTATGGCTGTGTTGCTCATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802507.1
MTGAGSSCGACKFLRRRCILDCTFAPHFSYEQAAAHFAAVHRVFGARNVSKMLLRLPLHSRGDAAAMICYEALARVQDPVYGCVAHVFALQHQVAMLKEEIEAIETQMADLVVDTSTSSLHSFAPSSVGCSDQHSSCMPLSADASVNRACCSSHIEIEHGLCLQKTLQELQEYCYLQPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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