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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001298`

染色体: Chr03 坐标: 15191828-15199364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001298`
名称	SmilChr03G001298
描述	uncharacterized SmilChr03G001298
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15191828 - 15199364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017805`
GeneID	`131017805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017805`
原始查询	`SmilChr03G001298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOW protein: zinc finger CCCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835425]; symbol=AT5G53440; hit=AT5G53440; species=arabidopsis; confidence=low
产物	LOW protein: zinc finger CCCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835425]; symbol=AT5G53440; hit=AT5G53440; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G53440` (AT5G53440) LOW protein: zinc finger CCCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835425] identity=32.3; qcov=0.562; evalue=4.44e-77; confidence=low
Rice	`Os01g0655400` (OSJNBa0049H05.21-2) - identity=30; qcov=0.639; evalue=2.11e-54; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802520.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057802520.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057802520.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802520.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15193026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B101,C65
`Chr3:15193161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,C58,C85
`Chr3:15193168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:15193303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B20
`Chr3:15193304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr3:15194288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:15194442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B73,C86
`Chr3:15194555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B9,B99,C26,C47
`Chr3:15194734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B81
`Chr3:15194880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B108
`Chr3:15194898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C49
`Chr3:15194974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B9,B99,C26,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946537.1
CTCGCTATGCACACACGAAACACACAAACCTCCGCAAAAAAGTGGAATGGCGACAGTGGCACCTCGTAAATTAAAACTATGCCCGAGGACAAAATCGTCTTTTGAAGCAGCCAGTTATCCGCGATGCCCCAAAACGATTTGTAATTACGCAGCTAACAACCAAAACATCAAGACCTCGCCTCCGATCTCTCTCTCACTACTCTCTCTCTCCGTGTCCCAAAATTTTCCAATTTCTTCTTCACTTTTTCTCTTTTCCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017805
ATGCCCAGGAGTTCGAGGCACAAATCGCACAAACAGAGCAAACACAGCTCAAGGGACTATTCGGACTCCGAAGAGGATGTAGTGAAGATGAAAGAGAAAAGTAGTAAAGATGATTCGGTTCGGGCTCATCGGGATTCAGCATCTGGTGAGAAGAGAAAGGTTTCATCTCAGGTGCGGGAAGGCAAGGACAGTAAAGATCTGAGCGGCCACGGGAATGGCGATGCCTTGGAGGAGTATGTTTCATCCAAACGACGGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802520.1
MPRSSRHKSHKQSKHSSRDYSDSEEDVVKMKEKSSKDDSVRAHRDSASGEKRKVSSQVREGKDSKDLSGHGNGDALEEYVSSKRRKEKTDVAIGGDRWNGGGDERGDNDRNAEKDIHKGENLKVDSKGKENSGKGESLRVDSKSKSKRYESGNAGERKEDSLTSALVDREESKSKGESKRKSERDSSSRKEVLKDKDRRSDKEKNGGQESKGGDAEVKIVDLDVGKKQGPLPGDFIEERQGKRARENTERVLLDELRNPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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