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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001299`

染色体: Chr03 坐标: 15217991-15218827 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001299`
名称	SmilChr03G001299
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit S, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15217991 - 15218827 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017806`
GeneID	`131017806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017806`
原始查询	`SmilChr03G001299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit S, chloroplastic
产物	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit S%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G23890` (NdhS) NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit S [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828489] identity=61.3; qcov=0.888; evalue=3.19e-72; confidence=high
Rice	`Os07g0196200` - identity=54.3; qcov=0.865; evalue=2.24e-61; confidence=high
GO	GO:0009767 (photosynthetic electron transport chain)
KEGG	-
Pfam	PF11623 (NdhS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057802521.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057802521.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057802521.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057802521.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15218158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B12,B85,D2
`Chr3:15218201`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A8
`Chr3:15218201`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A8
`Chr3:15218207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr3:15218262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B81
`Chr3:15218265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:15218413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:15218444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802521.1

215 aa

108

215

NdhS

PF11623 NdhS 140-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802521.1`	Pfam	`PF11623`	NdhS	Family	140	191	7e-28	96.7	NAD(P)H dehydrogenase subunit S

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946538.1
ATATATAAATGGAAACAATCCCAAACTTATTTGTGGCCAAAATCTCATCTTTCACCTCCCTCTGTCTCTCTCTCAAAACATGGCTGCTTCTTTCCATCTTCAAACCCTACACCTCCGCAAATCCCCTTTCCTCCAAAAACCATCTCCCAAATTCCCCAAACGAAGCACCACCACCGCCAAATTCAACCTCTACGAAATCCTCGGCGGCCGCGGCCTCTGCAACGGCGAGCAGGGCCTCCAGCAGGAACTCAAAAAAACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017806
ATGGCTGCTTCTTTCCATCTTCAAACCCTACACCTCCGCAAATCCCCTTTCCTCCAAAAACCATCTCCCAAATTCCCCAAACGAAGCACCACCACCGCCAAATTCAACCTCTACGAAATCCTCGGCGGCCGCGGCCTCTGCAACGGCGAGCAGGGCCTCCAGCAGGAACTCAAAAAAACCGTCGCACCACCACCACCTCCGCCGCCGCCGCAATTGGAGGATCAATCGGCAGAAGCTCTAGAAGTATCCGAAGACGGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802521.1
MAASFHLQTLHLRKSPFLQKPSPKFPKRSTTTAKFNLYEILGGRGLCNGEQGLQQELKKTVAPPPPPPPPQLEDQSAEALEVSEDGFEKELLGLTGGFPGGEKGLKKFIEENPPPPPPKSESVGFDRSNAKAKAPELPLLLPGMIAIVKNPRNPFHMYCGIVQRISDGKAGVLFEGGNWDKLVTFRLDELERRDKGPPMVNPRSAILENAVENTT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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