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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001301`

染色体: Chr03 坐标: 15226190-15228415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001301`
名称	SmilChr03G001301
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15226190 - 15228415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018431`
GeneID	`131018431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018431`
原始查询	`SmilChr03G001301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29.2; qcov=0.772; evalue=6.01e-86; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=32.1; qcov=0.752; evalue=2.13e-107; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803137.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803137.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803137.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803137.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803137.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15226210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C37,D6
`Chr3:15226329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C37,D6
`Chr3:15226360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C37,D6
`Chr3:15226425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C37,D6
`Chr3:15226524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B52,C72
`Chr3:15226537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B54,B86,C73
`Chr3:15226543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C37,D6
`Chr3:15226643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:15226651`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr3:15226651`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr3:15226678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C56
`Chr3:15226701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B136,B52,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803137.1

741 aa

370

741

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 103-192 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 291-398 aa PF10551 MULE 316-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803137.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	103	192	1.9e-17	64.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057803137.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	291	398	8.5e-07	29.7	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057803137.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	316	410	3.3e-27	95.4	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947154.1
ATGAACAATATTGATTTGAACAATTCTTATGCCACTGAGACATTTGGAGAATCATTTAACGGTGATGTTAACTCTCGGGGGTCTGAGGAGGGTGATCCACATGGGTACACGGACACCGATTCATTGTTTGATAGAAATGCCGATGATGACGTTGAAGGCGACGCCGATGCGGACACGGAGACAGAAATTTGTGAGTCACAAGCTAATCTCAATGATGGCATTGATTCTTTTGAATCGTTGAAGAAAAGTTTTGAGATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018431
ATGAACAATATTGATTTGAACAATTCTTATGCCACTGAGACATTTGGAGAATCATTTAACGGTGATGTTAACTCTCGGGGGTCTGAGGAGGGTGATCCACATGGGTACACGGACACCGATTCATTGTTTGATAGAAATGCCGATGATGACGTTGAAGGCGACGCCGATGCGGACACGGAGACAGAAATTTGTGAGTCACAAGCTAATCTCAATGATGGCATTGATTCTTTTGAATCGTTGAAGAAAAGTTTTGAGATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803137.1
MNNIDLNNSYATETFGESFNGDVNSRGSEEGDPHGYTDTDSLFDRNADDDVEGDADADTETEICESQANLNDGIDSFESLKKSFEMKLAVGTEIDILYAVHKLYCDYAAVMGFSVRKGNQEYFNPPDDVRMKMYHCSCAGTADNKSSKGRIAAYKKQSYRSNCEAKLRVVRDDIETPWRITLFVKQHNHELVNPRQTYLLRSARNMSRQKKQLLISMRASGIGVSKAYRFLEDEAGGRENIGFIRKDVYNALNSENRNMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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