当前解析结果
SmilChr03G001304| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001304 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001304 |
| 描述 | mitochondrial import receptor subunit TOM20-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 15271009 - 15277782 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017810 |
|---|---|
| GeneID | 131017810 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017810 |
| 原始查询 | SmilChr03G001304 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial import receptor subunit TOM20-like |
| 产物 | mitochondrial import receptor subunit TOM20-like |
| Arabidopsis | AT3G27080 (TOM20-3)translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822326] identity=55.5; qcov=0.99; evalue=9.1e-80; confidence=high |
| Rice | Os01g0921600 (TOM20)- identity=52.5; qcov=0.99; evalue=1.62e-73; confidence=high |
| GO | GO:0005515 (protein binding); GO:0005742 (mitochondrial outer membrane translocase complex); GO:0045040 (protein insertion into mitochondrial outer membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06552 (TOM20_plant) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017810 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057802524.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.80000 | XP_057802524.1 |
| 3 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.60000 | XP_057802524.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802524.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802524.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057802524.1PF06552
TOM20_plant 7-195 aa
XP_057802525.1PF06552
TOM20_plant 7-195 aa
XP_057802526.1PF06552
TOM20_plant 7-194 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057802524.1 |
Pfam | PF06552 |
TOM20_plant | Repeat | 7 | 195 | 1.7e-89 | 299.3 | Plant specific mitochondrial import receptor subunit TOM20 |
XP_057802525.1 |
Pfam | PF06552 |
TOM20_plant | Repeat | 7 | 195 | 1.7e-89 | 299.3 | Plant specific mitochondrial import receptor subunit TOM20 |
XP_057802526.1 |
Pfam | PF06552 |
TOM20_plant | Repeat | 7 | 194 | 1e-89 | 300.1 | Plant specific mitochondrial import receptor subunit TOM20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。